More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0008 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0008  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 
200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1045  DNA polymerase III subunit beta  59.14 
 
 
393 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000409555  unclonable  0.00000000281863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1016  DNA polymerase III subunit beta  59.14 
 
 
393 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  59.68 
 
 
382 aa  231  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0002  DNA polymerase III subunit beta  59.36 
 
 
387 aa  228  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273248  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0340  DNA polymerase III subunit beta  57.45 
 
 
394 aa  224  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  54.5 
 
 
390 aa  218  6e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0199  DNA polymerase III subunit beta  55.38 
 
 
374 aa  214  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000579402  normal  0.0770055 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00001  DNA polymerase III subunit beta  48.17 
 
 
388 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0001  DNA polymerase III subunit beta  49.2 
 
 
385 aa  180  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00001  DNA polymerase III subunit beta  44.39 
 
 
386 aa  174  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1328  DNA polymerase III subunit beta  43.37 
 
 
386 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  44.67 
 
 
385 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  44.33 
 
 
385 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00001  DNA polymerase III subunit beta  44.39 
 
 
397 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.284448  normal  0.0167825 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00001  DNA polymerase III subunit beta  44.12 
 
 
385 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  45.5 
 
 
385 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00001  DNA polymerase III subunit beta  39.02 
 
 
385 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.354313  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0075  DNA polymerase III beta subunit family protein  31.91 
 
 
444 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.912734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.24 
 
 
369 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0003  DNA polymerase III, beta subunit  32.07 
 
 
366 aa  103  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  30.32 
 
 
376 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.9 
 
 
366 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00020  DNA polymerase III, beta subunit  30.73 
 
 
365 aa  98.6  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443906  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.61 
 
 
377 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.61 
 
 
377 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  29.83 
 
 
367 aa  95.1  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.85 
 
 
374 aa  94.7  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  30.65 
 
 
377 aa  94  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.1 
 
 
370 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.98 
 
 
365 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  28.89 
 
 
373 aa  90.9  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  27.17 
 
 
366 aa  89.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  27.37 
 
 
377 aa  89.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.81 
 
 
378 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  27.72 
 
 
378 aa  88.2  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 
375 aa  88.2  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.17 
 
 
366 aa  87.8  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.17 
 
 
366 aa  87.8  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.27 
 
 
367 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1513  DNA polymerase III, beta subunit  27.89 
 
 
381 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000166783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  27.17 
 
 
378 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00020  DNA polymerase III, beta subunit  28.26 
 
 
365 aa  87  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000592113  decreased coverage  0.0000599685 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.35 
 
 
380 aa  86.7  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.11 
 
 
372 aa  86.3  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  27.17 
 
 
378 aa  85.5  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  31.87 
 
 
376 aa  84.7  8e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.91 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  31.91 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.91 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0010  DNA polymerase III subunit beta  29.9 
 
 
398 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716793  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.45 
 
 
380 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000143991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.91 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  31.02 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.18 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.9 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.042032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.9 
 
 
398 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  25.56 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.22 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  31.02 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  25.56 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  32.09 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0826  DNA polymerase III subunit beta  29.5 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0003  DNA polymerase III, beta subunit  27.66 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000352181 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.25 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  32.09 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.09 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  29.84 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  26.11 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  31.02 
 
 
381 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.67 
 
 
372 aa  82.4  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  25.56 
 
 
385 aa  82  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.76 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298765  normal  0.252015 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.65 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40244  normal  0.672581 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12563  DNA polymerase III, beta chain  25.13 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.152259  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  25.84 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0002  DNA polymerase III subunit beta  27.54 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0019  DNA polymerase III, beta subunit  23.96 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  27.66 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10002  DNA polymerase III subunit beta  28.37 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.95 
 
 
379 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000269969  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.63 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  26.52 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  25.81 
 
 
377 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  27.22 
 
 
412 aa  79  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0002  DNA-directed DNA polymerase  29.8 
 
 
379 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000640008  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  30.21 
 
 
374 aa  78.2  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0002  DNA polymerase III subunit beta  26.67 
 
 
373 aa  78.2  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.572668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  25 
 
 
372 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5506  DNA polymerase III, beta subunit  28.43 
 
 
479 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  29.28 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.8 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0259305  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  28.96 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  25.56 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  25.41 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  28.96 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  25.56 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  27.62 
 
 
372 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  28.57 
 
 
388 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  26.11 
 
 
372 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>