29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0003 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0003    100 
 
 
342 bp  678    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3299    89.87 
 
 
773 bp  361  8e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000302291  decreased coverage  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3608    89.22 
 
 
635 bp  339  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0026    87.73 
 
 
549 bp  321  7e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0860    86.39 
 
 
443 bp  293  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3946    89.66 
 
 
486 bp  270  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384523  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3176    90.28 
 
 
300 bp  262  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3652  IS630 family transposase  91.37 
 
 
243 bp  256  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.267195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4046    85.02 
 
 
589 bp  252  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637068  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1391    90.59 
 
 
455 bp  250  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0037  IS630 family transposase  93.01 
 
 
207 bp  204  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228515  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1373    83.77 
 
 
729 bp  202  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1267  IS630 family transposase  89.57 
 
 
168 bp  180  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590086  normal  0.0269079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3615    85.65 
 
 
318 bp  176  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4851    92.04 
 
 
351 bp  153  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0004    100 
 
 
399 bp  151  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3655    86.52 
 
 
327 bp  81.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3656  IS630 family transposase  88.57 
 
 
180 bp  75.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0030    91.3 
 
 
302 bp  60  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171552  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  100 
 
 
297 bp  58  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0926    88.37 
 
 
291 bp  46.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  96.3 
 
 
294 bp  46.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  85.45 
 
 
848 bp  46.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4530    85.45 
 
 
2068 bp  46.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  85.45 
 
 
848 bp  46.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  85.45 
 
 
848 bp  46.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  85.45 
 
 
848 bp  46.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  85.45 
 
 
848 bp  46.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  85.45 
 
 
848 bp  46.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.897046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>