251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_R0007 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_R0007  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  94.12 
 
 
74 bp  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  96.67 
 
 
74 bp  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  94.12 
 
 
74 bp  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  92.65 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  95 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  92.65 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  92.65 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  91.18 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12430  tRNA-Gly  91.18 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0005  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.582473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  91.18 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0024  tRNA-Gly  90.28 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0067  tRNA-Gly  91.04 
 
 
71 bp  85.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.294367 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  93.1 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  91.67 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  89.71 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  89.71 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  89.71 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0047  tRNA-Gly  88.89 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  89.71 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0023  tRNA-Gly  88.89 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0036  tRNA-Gly  89.55 
 
 
71 bp  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0036  tRNA-Gly  88.73 
 
 
71 bp  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0180  tRNA-Gly  88.73 
 
 
71 bp  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0303819  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  91.38 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0090  tRNA-Gly  88.24 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  88.24 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  88.24 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  88.24 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0004  tRNA-Gly  90 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786418  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  88.24 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  88.24 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  88.24 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38700  tRNA-Gly  90 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  88.24 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  88.24 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  88.24 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0004  tRNA-Gly  90 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0017  tRNA-Gly  88.24 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.77032  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0001  tRNA-Gly  90 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.508752  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0057  tRNA-Gly  91.07 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0051  tRNA-Gly  88.24 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.637651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0128  tRNA-Gly  88.24 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.521408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0004  tRNA-Gly  90 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699145  normal  0.0309415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  87.5 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0007  tRNA-Gly  90 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00254544  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  88.24 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14004  tRNA-Gly  90 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0028  tRNA-Gly  88.24 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0058  tRNA-Gly  90 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00122195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0079  tRNA-Gly  88.06 
 
 
71 bp  69.9  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926442  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1215  tRNA-Gly  87.32 
 
 
71 bp  69.9  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R23  tRNA-Gly  92 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2154  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.480765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2514  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0272965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2521  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000668115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2524  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000475976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2532  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2620  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0852955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2627  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2629  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1865  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2218  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000193879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2225  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000670564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2228  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000002233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2306  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000790544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2313  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2315  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.951593  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0053  tRNA-Gly  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0003  tRNA-Gly  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0059  tRNA-Gly  88.33 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0061  tRNA-Gly  88.33 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0033  tRNA-Gly  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535197  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0035  tRNA-Gly  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.812042  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0057  tRNA-Gly  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0055  tRNA-Gly  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.273578  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0031  tRNA-Gly  86.76 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  86.57 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA7  tRNA-Gly  89.09 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0002    89.09 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462188  normal  0.531526 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  86.57 
 
 
71 bp  61.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0014  tRNA-Gly  89.09 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0003  tRNA-Gly  89.09 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0073  tRNA-Gly  89.09 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0022  tRNA-Gly  89.09 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.274402  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0004  tRNA-Gly  89.09 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0058  tRNA-Gly  89.09 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0034  tRNA-Gly  90 
 
 
71 bp  60  0.00000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.849322  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0065  tRNA-Gly  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0067  tRNA-Gly  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.38974  normal  0.157236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>