More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4980 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  100 
 
 
210 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  65.22 
 
 
236 aa  257  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  64.97 
 
 
226 aa  244  8e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  70.43 
 
 
237 aa  239  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  59.62 
 
 
245 aa  233  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  61.14 
 
 
213 aa  225  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  57.34 
 
 
242 aa  225  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  61.78 
 
 
250 aa  215  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  61.01 
 
 
242 aa  214  8e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  66.67 
 
 
236 aa  204  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  56.41 
 
 
241 aa  202  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  54.25 
 
 
239 aa  200  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  53.05 
 
 
227 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  50 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  56.54 
 
 
223 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  53.85 
 
 
221 aa  194  7e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  55.67 
 
 
254 aa  191  7e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  54.59 
 
 
225 aa  191  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  50.76 
 
 
228 aa  190  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  53.61 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  53.61 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  53.09 
 
 
225 aa  187  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  52.56 
 
 
262 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  48.7 
 
 
210 aa  184  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  51.55 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  51.04 
 
 
210 aa  181  9.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  53.23 
 
 
241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  52.06 
 
 
224 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  47.89 
 
 
265 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  51.34 
 
 
205 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  57.56 
 
 
222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  51.92 
 
 
306 aa  171  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  50.8 
 
 
212 aa  171  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  54.64 
 
 
223 aa  171  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  48.96 
 
 
242 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  47 
 
 
228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  43.41 
 
 
221 aa  154  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  40 
 
 
255 aa  144  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  41.25 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  45.45 
 
 
209 aa  105  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  34.68 
 
 
239 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  36.21 
 
 
239 aa  104  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  43.59 
 
 
212 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  34.1 
 
 
239 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  39.74 
 
 
211 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  40.38 
 
 
211 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  39.74 
 
 
211 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  33.66 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1731  methyltransferase GidB  30.93 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  38.12 
 
 
211 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  41.36 
 
 
234 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  39.1 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  38.1 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  41.81 
 
 
238 aa  95.9  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23540  methyltransferase GidB  31.58 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  28.99 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  28.16 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  38.06 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  31.9 
 
 
237 aa  93.2  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  34.24 
 
 
239 aa  93.2  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1084  methyltransferase GidB  29.65 
 
 
231 aa  94  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  34.36 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4305  methyltransferase GidB  31.33 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.412707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3365  16S rRNA methyltransferase GidB  44.68 
 
 
234 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  33.52 
 
 
211 aa  91.7  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  28.9 
 
 
242 aa  91.7  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  36.24 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  36.24 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  36.24 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  36.24 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  36.24 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  36.24 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  36.24 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  36.24 
 
 
207 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  31.32 
 
 
216 aa  90.5  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  41.94 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  30 
 
 
239 aa  90.9  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  37.33 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  36.31 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  41.94 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  39.07 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0251  methyltransferase GidB  27.5 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  43.7 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  31.49 
 
 
240 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  43.26 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  33.33 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  37.33 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  37.58 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  33.56 
 
 
242 aa  89.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  31.67 
 
 
240 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  37.33 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl662  16S rRNA methyltransferase GidB  27.91 
 
 
237 aa  89  4e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  35.76 
 
 
206 aa  89  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  34.12 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5944  methyltransferase GidB  40 
 
 
245 aa  88.6  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  34.12 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  34.12 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  34.12 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  35.71 
 
 
228 aa  88.2  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>