More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4977 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  100 
 
 
312 aa  617  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  66.56 
 
 
323 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  64.22 
 
 
333 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  66.23 
 
 
318 aa  388  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  72.52 
 
 
309 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  67.65 
 
 
295 aa  368  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  64.35 
 
 
324 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  60.37 
 
 
328 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  64.12 
 
 
321 aa  364  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  65.69 
 
 
329 aa  359  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  65.93 
 
 
335 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3372  parB-like partition protein  63.89 
 
 
529 aa  355  3.9999999999999996e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37980  chromosome segregation DNA-binding protein  67.88 
 
 
392 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  61.18 
 
 
379 aa  348  5e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  60.87 
 
 
331 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4236  parB-like partition protein  58.21 
 
 
341 aa  342  5e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6071  parB-like partition proteins  58.91 
 
 
334 aa  339  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.164971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3719  parB-like partition protein  63.99 
 
 
383 aa  338  9e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118734  hitchhiker  0.00185127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13952  chromosome partitioning protein parB  58.21 
 
 
344 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4217  parB-like partition protein  60.47 
 
 
472 aa  337  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0001  chromosome segregation DNA-binding protein  58.23 
 
 
330 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5782  chromosome segregation DNA-binding protein  58.23 
 
 
330 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5406  chromosome segregation DNA-binding protein  58.23 
 
 
330 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0835  parB-like partition protein  58.2 
 
 
331 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  58.79 
 
 
314 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26960  chromosome segregation DNA-binding protein  51.9 
 
 
367 aa  329  3e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4857  parB-like partition protein  52.16 
 
 
391 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4506  parB-like partition protein  65.06 
 
 
410 aa  314  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5407  parB-like partition protein  63.64 
 
 
377 aa  314  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  58.48 
 
 
358 aa  312  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5089  parB-like partition protein  53.33 
 
 
347 aa  308  9e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1443  putative transcriptional regulator  53.51 
 
 
424 aa  305  7e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3930  parB-like partition protein  61.32 
 
 
438 aa  296  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000021356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9049  parB-like partition protein  57.52 
 
 
398 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.740864  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  59.52 
 
 
268 aa  288  7e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4165  chromosome segregation DNA-binding protein  61.73 
 
 
394 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308582  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31910  ParB-like partition protein  59.34 
 
 
624 aa  277  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0053  ParB-like protein  52 
 
 
450 aa  269  4e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  49.37 
 
 
306 aa  247  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  39.93 
 
 
306 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  42.57 
 
 
294 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  41.96 
 
 
289 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  38.94 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  43 
 
 
305 aa  222  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  45.33 
 
 
294 aa  222  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  41.53 
 
 
272 aa  221  9e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  42.38 
 
 
282 aa  221  9e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  42.95 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  46.38 
 
 
297 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  40.6 
 
 
283 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  44.33 
 
 
288 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  40.27 
 
 
283 aa  218  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  45.16 
 
 
319 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  40.27 
 
 
283 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  40.6 
 
 
283 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  40.4 
 
 
285 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  40.6 
 
 
283 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  40.67 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  44.56 
 
 
297 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  41 
 
 
298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  39.26 
 
 
289 aa  216  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  40.27 
 
 
283 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  40.27 
 
 
283 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  39.73 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  51.91 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  42.42 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  43.46 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  40.26 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  43.38 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  39.8 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  40.2 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  40.27 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  39.93 
 
 
283 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  43.19 
 
 
256 aa  212  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  37.76 
 
 
286 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  37.76 
 
 
286 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  49.14 
 
 
287 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  37.87 
 
 
283 aa  211  2e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  42.62 
 
 
293 aa  209  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  42.62 
 
 
293 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  41.35 
 
 
303 aa  209  5e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  42.8 
 
 
256 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  41.28 
 
 
294 aa  209  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  42.52 
 
 
286 aa  208  8e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  42.62 
 
 
293 aa  208  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  42.28 
 
 
290 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  39.53 
 
 
281 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  42.19 
 
 
284 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  42.38 
 
 
309 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  39.26 
 
 
283 aa  206  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  41.61 
 
 
290 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  42.95 
 
 
283 aa  205  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  41.61 
 
 
290 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  40.4 
 
 
294 aa  205  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  38.61 
 
 
305 aa  205  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  43.14 
 
 
295 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  37.7 
 
 
296 aa  203  2e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  41.8 
 
 
310 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  40.47 
 
 
304 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  38.93 
 
 
279 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>