37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4934 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 487 aa  927    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  38.84 
 
 		 442 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9326  putative transcriptional regulator, XRE family  36.16 
 
 		 452 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  38.62 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  38.78 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3127  helix-turn-helix domain protein  36.08 
 
 		 434 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.641093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  38.68 
 
 		 403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5720  hypothetical protein  30.45 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0172  helix-turn-helix domain-containing protein  26.71 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  35.63 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  35.63 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  35.63 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  35.63 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  35.63 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  36.76 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 403 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  32.74 
 
 		 188 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 421 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 176 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2571  helix-turn-helix domain protein  30.14 
 
 		 475 aa  47  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.576414  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 261 aa  47  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  22.3 
 
 		 436 aa  47  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  31.82 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0397  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 		 475 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264481  normal  0.0251152 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  31.82 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  27.83 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 264 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  36.67 
 
 		 206 aa  43.5  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>