231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4842 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 413 aa  798    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  59 
 
 		 408 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  49.1 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  49.21 
 
 		 436 aa  322  8e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  44.5 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  50.13 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  47.95 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  48.47 
 
 		 453 aa  312  4.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  44.55 
 
 		 414 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  46.5 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  48.64 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  51.8 
 
 		 462 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  50.64 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  48.86 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  51.26 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  46.41 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  50.38 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  44.1 
 
 		 402 aa  300  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  49.62 
 
 		 461 aa  297  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  49.74 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  50.84 
 
 		 431 aa  292  7e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.98 
 
 		 450 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.73 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.73 
 
 		 450 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  52.41 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.69 
 
 		 464 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  47.98 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.17 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  46.72 
 
 		 429 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  48.81 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.67 
 
 		 449 aa  269  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  43.08 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.76 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.22 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.7 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.64 
 
 		 400 aa  244  3e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.34 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.02 
 
 		 399 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  39.48 
 
 		 382 aa  242  7.999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  47.24 
 
 		 436 aa  242  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  39.66 
 
 		 876 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  37.34 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  37.67 
 
 		 386 aa  240  4e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.96 
 
 		 391 aa  239  8e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  43.33 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.65 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  37.23 
 
 		 465 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  38.15 
 
 		 438 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  36.98 
 
 		 424 aa  236  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  38.14 
 
 		 396 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.47 
 
 		 392 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  42.57 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  35.17 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  40.49 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.43 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.79 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1826  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.83 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.243343  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  37.27 
 
 		 394 aa  232  7.000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  36.93 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  35.6 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0683  Kef-type K+ transport system membrane protein  37.93 
 
 		 472 aa  230  4e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  35.84 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  36.1 
 
 		 382 aa  229  9e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.2 
 
 		 389 aa  229  9e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  40.53 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.22 
 
 		 420 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  40.16 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  36.1 
 
 		 382 aa  227  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  39.42 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.06 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.06 
 
 		 393 aa  226  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  36.11 
 
 		 393 aa  226  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  39.48 
 
 		 481 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  42.94 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.06 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  40.73 
 
 		 423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  38.32 
 
 		 425 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2645  Na+/H+ antiporter NhaA  40.37 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.89 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.36 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.89 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.89 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.89 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.35 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  37.65 
 
 		 455 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.89 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.89 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  39.89 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1489  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.5 
 
 		 384 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  41 
 
 		 445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.89 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  36.9 
 
 		 453 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.76 
 
 		 388 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.76 
 
 		 388 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.76 
 
 		 388 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.76 
 
 		 388 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.76 
 
 		 388 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.71 
 
 		 400 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  39.13 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  37.53 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>