256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4799 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 258 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  58.78 
 
 		 262 aa  264  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  39.71 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  36.96 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  37 
 
 		 274 aa  135  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 270 aa  118  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  36.4 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  36.55 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 292 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  25.19 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  33.71 
 
 		 272 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  33.99 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  34.54 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  31.76 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  29.89 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 287 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 281 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  31.56 
 
 		 271 aa  89  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 269 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 276 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 287 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  26 
 
 		 276 aa  85.9  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  31.23 
 
 		 286 aa  85.5  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  26.12 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  25.4 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  23.72 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  25.37 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  25.75 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  26.47 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  25.27 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  23.97 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  48.08 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  23.13 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  31.73 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  32.64 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  21.56 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  46 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  39.01 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  23.94 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  25.94 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  23.57 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  30.45 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  28.62 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  29.74 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  23.13 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  44 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  31.58 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.83 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  25.47 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  71.11 
 
 		 132 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  33.47 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  23.44 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  29.12 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  39.09 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  37.11 
 
 		 399 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  23.99 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  48.53 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  25.39 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  27.66 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  52.05 
 
 		 355 aa  62  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  30.94 
 
 		 156 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  35.42 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  50 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  45.33 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  43.08 
 
 		 132 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  36.27 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  42.86 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  54.39 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 354 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  31.07 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  28.43 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>