More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4727 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
441 aa  847    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  54.59 
 
 
418 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  53.85 
 
 
423 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  53.77 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  54.59 
 
 
447 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  55.33 
 
 
426 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  55.33 
 
 
426 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  55.03 
 
 
443 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  51.83 
 
 
442 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  50.61 
 
 
448 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  51.52 
 
 
446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  45.1 
 
 
447 aa  326  6e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  48.38 
 
 
398 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  47.82 
 
 
423 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  47.99 
 
 
428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 
438 aa  313  4.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  46.08 
 
 
442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  49.18 
 
 
460 aa  285  9e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  45.99 
 
 
446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 
439 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0829  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 
430 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145147  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 
486 aa  232  8.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  36.57 
 
 
430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
421 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
441 aa  133  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  32.16 
 
 
434 aa  132  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
437 aa  130  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  29.47 
 
 
417 aa  129  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  31.19 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 
439 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  29.92 
 
 
434 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  29.19 
 
 
428 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  28.9 
 
 
428 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  29.36 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  29.72 
 
 
430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  28.79 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.7 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  29.53 
 
 
428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  29.53 
 
 
428 aa  114  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  24.82 
 
 
434 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  28.53 
 
 
430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  28.4 
 
 
430 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  27.03 
 
 
417 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  23.72 
 
 
432 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  23.72 
 
 
432 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  24.58 
 
 
434 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  24.66 
 
 
426 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  24.14 
 
 
426 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  23.99 
 
 
426 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  28.1 
 
 
418 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  25.25 
 
 
445 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  27.27 
 
 
425 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  27.27 
 
 
425 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  26.44 
 
 
443 aa  100  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  26.44 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
446 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  25 
 
 
423 aa  97.8  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  24.79 
 
 
423 aa  97.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  26.48 
 
 
432 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 
411 aa  94.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
415 aa  93.2  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
395 aa  92.8  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
425 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  23.79 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  24.55 
 
 
431 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  22.62 
 
 
366 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  30.98 
 
 
414 aa  90.5  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  22.62 
 
 
366 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  26.21 
 
 
452 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  26.21 
 
 
452 aa  88.2  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  27.59 
 
 
437 aa  87  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  27.59 
 
 
437 aa  86.3  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  32.05 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  27.57 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  24.16 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  23.08 
 
 
443 aa  83.2  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  23.9 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  27.32 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  25.37 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  29.24 
 
 
412 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  22.73 
 
 
429 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  27.3 
 
 
451 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2985  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.124537 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  25.7 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  28.14 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  28.14 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  28.14 
 
 
439 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  28.95 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  25.23 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3760  MFS family transporter  28.05 
 
 
447 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  28.09 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  28.09 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  23.59 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  36.15 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  34.57 
 
 
425 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  28.97 
 
 
407 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  25.07 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>