More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4678 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 539 aa  1068    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  56.24 
 
 		 534 aa  568  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  55.51 
 
 		 541 aa  542  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  50.48 
 
 		 532 aa  489  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  51.31 
 
 		 546 aa  490  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  49.91 
 
 		 562 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  48.04 
 
 		 539 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  47.12 
 
 		 541 aa  433  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  48.32 
 
 		 560 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  48.51 
 
 		 550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  45.25 
 
 		 548 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  43.5 
 
 		 560 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  45.25 
 
 		 548 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  45.25 
 
 		 548 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  45.32 
 
 		 535 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  45.05 
 
 		 540 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  45 
 
 		 530 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  43.44 
 
 		 535 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  40.18 
 
 		 564 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  44.38 
 
 		 542 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  41.6 
 
 		 574 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  39.56 
 
 		 569 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  42.57 
 
 		 544 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  41.42 
 
 		 577 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  45.85 
 
 		 527 aa  385  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  41.42 
 
 		 577 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  45.62 
 
 		 550 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  41.28 
 
 		 544 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  43.19 
 
 		 545 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  40.58 
 
 		 544 aa  352  7e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  41.14 
 
 		 531 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 510 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 516 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.72 
 
 		 500 aa  233  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.77 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6898  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 536 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.68 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.77 
 
 		 525 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 532 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  34.27 
 
 		 492 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 508 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.22 
 
 		 497 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.22 
 
 		 497 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  28.97 
 
 		 500 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.16 
 
 		 524 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  28.69 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 		 525 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.91 
 
 		 525 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  29.21 
 
 		 500 aa  212  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.09 
 
 		 514 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 508 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  29.03 
 
 		 544 aa  211  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.69 
 
 		 500 aa  211  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  28.88 
 
 		 500 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  28.54 
 
 		 499 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 499 aa  210  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 520 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  28.29 
 
 		 500 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  28.29 
 
 		 500 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.6 
 
 		 497 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 512 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  28.31 
 
 		 488 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.15 
 
 		 543 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 508 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.74 
 
 		 526 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 517 aa  204  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 500 aa  204  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 515 aa  203  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 551 aa  203  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 521 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  29.41 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  29.41 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.2 
 
 		 509 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.53 
 
 		 509 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 508 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  30.66 
 
 		 527 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 662 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.45 
 
 		 514 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.63 
 
 		 516 aa  199  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  29.01 
 
 		 515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.31 
 
 		 529 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  31.16 
 
 		 549 aa  197  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.09 
 
 		 513 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 		 515 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 525 aa  197  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 546 aa  197  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 509 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 512 aa  196  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 508 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 492 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  31.08 
 
 		 508 aa  196  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 517 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  32.61 
 
 		 565 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 		 518 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>