More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4653 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4653  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 145 aa  280  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4875  transcriptional regulator, GntR family  45.19 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0091  GntR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 252 aa  77  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  46.67 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  47.95 
 
 		 253 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  45.56 
 
 		 238 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0046  transcriptional regulator, GntR family  42.22 
 
 		 244 aa  72  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 259 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 261 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0072  regulatory protein GntR, HTH  45.56 
 
 		 288 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.476491  normal  0.750222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  42.68 
 
 		 241 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 232 aa  70.1  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0337  GntR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1572  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 288 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2160  putative transcriptional regulator, GntR family  48.53 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.704107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7034  putative transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.88 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1076  GntR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0019673 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2239  GntR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0154  putative transcriptional regulator, GntR family  46.38 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3470  regulatory protein GntR HTH  35.06 
 
 		 364 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000106127  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 237 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  46.55 
 
 		 237 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 252 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 261 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 261 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 237 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 237 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  45.95 
 
 		 250 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  45.45 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  45.16 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1841  putative transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0164679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 243 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0917  transcriptional regulator, GntR family  45.88 
 
 		 280 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 		 242 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  45.95 
 
 		 241 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  43.66 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 255 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  42.25 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  32.77 
 
 		 238 aa  60.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8668  putative transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  50 
 
 		 299 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 241 aa  60.8  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 259 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 249 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 248 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  36.78 
 
 		 238 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  44.78 
 
 		 246 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0510  trehalose operon repressor  44.29 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1165  histidine utilization repressor  45.59 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  40.62 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0497  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6099  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  42.42 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  37.5 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  47.76 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  43.08 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0129  UbiC transcription regulator-associated domain protein  37.84 
 
 		 579 aa  58.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.625714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3055  regulatory protein GntR HTH  50 
 
 		 285 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  51.79 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2925  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  43.94 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.608421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8675  putative transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  43.48 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  43.48 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1575  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  40.58 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0033  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 264 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 237 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 242 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  40.58 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 274 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 249 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  40.58 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  40.58 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  40.58 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  40.58 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  40.58 
 
 		 240 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 253 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  42.03 
 
 		 256 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  36.28 
 
 		 240 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  39.68 
 
 		 253 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>