More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4638 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
258 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  50.22 
 
 
222 aa  192  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
222 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1760  GntR family transcriptional regulator  48 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298302  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1807  GntR family transcriptional regulator  48 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1741  GntR family transcriptional regulator  48 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00122783  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4360  transcriptional regulator, GntR family  48.1 
 
 
226 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0130  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0123  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  normal  0.0318508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0715  regulatory protein GntR, HTH  40.22 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0114  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
231 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  35.32 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10166  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  35.21 
 
 
222 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 
233 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  33.64 
 
 
231 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
244 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
229 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
234 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
219 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
225 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
233 aa  99.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
235 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 
212 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3933  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.903638  decreased coverage  0.00636181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 
226 aa  96.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 
212 aa  95.1  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
237 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
223 aa  93.2  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
235 aa  92.8  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 
222 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 
211 aa  90.1  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
230 aa  90.5  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
235 aa  89.7  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
229 aa  89.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
219 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  34.13 
 
 
229 aa  85.9  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 
233 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
222 aa  85.5  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 
228 aa  85.9  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2514  transcriptional regulator, GntR family  30.47 
 
 
273 aa  85.5  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00436634  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2517  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 
235 aa  85.1  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3549  transcriptional regulator  31.55 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3620  transcriptional regulator  31.55 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0556349  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3655  transcriptional regulator  31.55 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  36.81 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
227 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3548  transcriptional regulator  31.55 
 
 
221 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3717  transcriptional regulator  31.55 
 
 
221 aa  82  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.297823 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  27.23 
 
 
224 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  30.15 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0958  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208617  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 
222 aa  79  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
231 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
242 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 
249 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
241 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  31.42 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2904  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  38.92 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2765  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0487708  normal  0.0102219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>