72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4575 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4575  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 513 aa  1020    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  32.26 
 
 		 347 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4877  AAA ATPase  37.23 
 
 		 856 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8334  hypothetical protein  33.15 
 
 		 308 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0824373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1230  hypothetical protein  32.3 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6886  hypothetical protein  30.84 
 
 		 258 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0964  hypothetical protein  27.41 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0063713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1332  hypothetical protein  31.29 
 
 		 751 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0324065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4519  hypothetical protein  27.91 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.11 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  27.81 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  34.78 
 
 		 524 aa  60.5  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.58 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.09 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  25.47 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6844  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.84 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0901192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.35 
 
 		 212 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 223 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1065 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  32.65 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 226 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.62 
 
 		 223 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  33 
 
 		 246 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.36 
 
 		 219 aa  50.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  50.4  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  29.84 
 
 		 223 aa  50.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  28.42 
 
 		 322 aa  50.1  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0398  hypothetical protein  33.1 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  32.73 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6990  hypothetical protein  29.31 
 
 		 281 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0692886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  28.21 
 
 		 205 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 248 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 247 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5645  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 240 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30.3 
 
 		 225 aa  48.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  29.05 
 
 		 449 aa  47.8  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.81 
 
 		 228 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0098  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 234 aa  47.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5851  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.12 
 
 		 242 aa  47.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  33 
 
 		 229 aa  47  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 246 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.69 
 
 		 222 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  27.62 
 
 		 215 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0632  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.71 
 
 		 236 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  29.55 
 
 		 286 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.99 
 
 		 227 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.360617  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 263 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  26.77 
 
 		 225 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  31.31 
 
 		 860 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 241 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5695  cyclic nucleotide-binding protein  34.78 
 
 		 233 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0746044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  27.62 
 
 		 215 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.53 
 
 		 225 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30 
 
 		 228 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 246 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0070  cyclic nucleotide-binding protein  32.65 
 
 		 227 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  29.52 
 
 		 237 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 		 224 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  34.65 
 
 		 160 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045265  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.83 
 
 		 242 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 507 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 246 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0436  transcription regulator  22.54 
 
 		 214 aa  44.3  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0316636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.96 
 
 		 231 aa  44.3  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4541  cyclic nucleotide-binding protein  28.85 
 
 		 426 aa  43.9  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.44 
 
 		 226 aa  43.9  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  21.89 
 
 		 275 aa  43.9  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  25.4 
 
 		 857 aa  43.5  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.83 
 
 		 228 aa  43.9  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  31.63 
 
 		 226 aa  43.5  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  30.48 
 
 		 147 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 250 aa  43.5  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>