More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4544 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  100 
 
 
671 aa  1281    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  51.54 
 
 
688 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  50.22 
 
 
686 aa  572  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  46.6 
 
 
686 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  45.29 
 
 
688 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  39.74 
 
 
901 aa  442  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  40.59 
 
 
730 aa  428  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  40.81 
 
 
709 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  44.64 
 
 
707 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  38.71 
 
 
707 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  40.87 
 
 
662 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  40 
 
 
705 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  38.73 
 
 
703 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 
727 aa  282  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
710 aa  270  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  59.07 
 
 
225 aa  228  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  55.45 
 
 
222 aa  225  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 
725 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  55.61 
 
 
213 aa  211  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  30.16 
 
 
642 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  52.66 
 
 
205 aa  207  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  50 
 
 
224 aa  198  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  48.45 
 
 
207 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  47.83 
 
 
207 aa  194  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  50 
 
 
243 aa  194  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  46.08 
 
 
206 aa  191  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  50.76 
 
 
210 aa  191  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  52.72 
 
 
234 aa  191  5.999999999999999e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  51.98 
 
 
202 aa  188  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  50 
 
 
232 aa  188  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  45.23 
 
 
204 aa  188  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  53.37 
 
 
226 aa  185  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  48.5 
 
 
215 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  47.64 
 
 
221 aa  184  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  49.24 
 
 
281 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  43.81 
 
 
216 aa  180  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  43.93 
 
 
215 aa  180  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  46.57 
 
 
207 aa  180  8e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  49.27 
 
 
221 aa  180  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  46.11 
 
 
214 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  49.49 
 
 
217 aa  179  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  49.47 
 
 
206 aa  177  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  45.27 
 
 
208 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  45.45 
 
 
217 aa  176  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  44.44 
 
 
213 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  46.27 
 
 
224 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  43.3 
 
 
210 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  45.59 
 
 
207 aa  174  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  45.41 
 
 
213 aa  173  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  42.86 
 
 
203 aa  170  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  44.78 
 
 
211 aa  170  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  46.19 
 
 
213 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  46.97 
 
 
209 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  45.45 
 
 
214 aa  170  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  50.98 
 
 
210 aa  169  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  50.79 
 
 
244 aa  169  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  44.55 
 
 
212 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  44.19 
 
 
215 aa  169  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  47.83 
 
 
207 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  39.91 
 
 
234 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  47 
 
 
244 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  43.5 
 
 
209 aa  165  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  44.78 
 
 
219 aa  165  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  45.05 
 
 
244 aa  165  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  44.88 
 
 
222 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  41.35 
 
 
219 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  46.67 
 
 
210 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  43.65 
 
 
213 aa  162  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  43.43 
 
 
218 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  47.12 
 
 
225 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  40 
 
 
211 aa  161  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  46.15 
 
 
210 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  42.56 
 
 
209 aa  161  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  43.36 
 
 
233 aa  161  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  43.06 
 
 
225 aa  161  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  49 
 
 
219 aa  161  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4707  dTMP kinase  49.23 
 
 
236 aa  160  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0191437 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  42.58 
 
 
214 aa  160  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  38.28 
 
 
213 aa  159  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  38.89 
 
 
208 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  38.89 
 
 
208 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  42.79 
 
 
211 aa  159  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  39.39 
 
 
208 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  39.39 
 
 
208 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  39.39 
 
 
208 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  42.57 
 
 
212 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  39.39 
 
 
208 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  39.39 
 
 
208 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  39.39 
 
 
208 aa  158  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  38.83 
 
 
208 aa  158  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  39.39 
 
 
208 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  43.81 
 
 
234 aa  157  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  39.39 
 
 
208 aa  158  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  41.1 
 
 
236 aa  157  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  42.11 
 
 
234 aa  157  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  42.71 
 
 
211 aa  156  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44 
 
 
216 aa  156  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  43.48 
 
 
225 aa  156  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0822  thymidylate kinase  40.19 
 
 
213 aa  155  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0899477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  40.4 
 
 
207 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>