More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4511 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  100 
 
 
388 aa  751    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  41.81 
 
 
394 aa  259  8e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  33.68 
 
 
340 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  48.98 
 
 
469 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  55.97 
 
 
531 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  48.28 
 
 
467 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  46.94 
 
 
467 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  46.94 
 
 
467 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  46.98 
 
 
472 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  46.94 
 
 
469 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  46.94 
 
 
469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  46.94 
 
 
469 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  46.94 
 
 
469 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  32.46 
 
 
458 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  49.64 
 
 
625 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  44.93 
 
 
478 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  44.2 
 
 
479 aa  142  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  45.86 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  45.86 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  45.86 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.04 
 
 
321 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
505 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  29.63 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  44.2 
 
 
472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  31.17 
 
 
342 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  36.76 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  32.08 
 
 
427 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  49.64 
 
 
337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  48.03 
 
 
345 aa  122  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  28.76 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  32 
 
 
375 aa  119  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  49.22 
 
 
447 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  29.04 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  47.5 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  47.29 
 
 
452 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  38.1 
 
 
337 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  45.31 
 
 
459 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  30.32 
 
 
319 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
374 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.96 
 
 
438 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  28.66 
 
 
337 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  44.14 
 
 
491 aa  105  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5324  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
256 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5687  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
256 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.444646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  29.15 
 
 
333 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  40.46 
 
 
256 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  40.46 
 
 
256 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  31.82 
 
 
348 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
398 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
257 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
257 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
257 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
256 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  44.78 
 
 
411 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
256 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  28.15 
 
 
330 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3688  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
248 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3662  NLP/P60 protein  40.58 
 
 
228 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
248 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  44.8 
 
 
308 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  29.55 
 
 
333 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
225 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
388 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  25.29 
 
 
350 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
180 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  38.66 
 
 
498 aa  97.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  28.87 
 
 
334 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  44.86 
 
 
164 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2748  NLP/P60 protein  39.47 
 
 
230 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.46287  normal  0.819631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2452  NLP/P60  38.6 
 
 
241 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2497  NLP/P60 protein  38.6 
 
 
241 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3442  Peptidase M23  43.75 
 
 
546 aa  96.3  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  40.46 
 
 
453 aa  96.7  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2489  NLP/P60 protein  38.6 
 
 
221 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0999493  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  39.55 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  28.06 
 
 
373 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4529  NLP/P60 protein  39.5 
 
 
239 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.612016  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  29.38 
 
 
347 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.13 
 
 
388 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8441  NLP/P60 protein  28.61 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.02 
 
 
332 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  39.47 
 
 
253 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  27.81 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  37.98 
 
 
432 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  40 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  32.33 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  45.53 
 
 
281 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  38.76 
 
 
368 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  41.79 
 
 
162 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  36.6 
 
 
1048 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.96 
 
 
329 aa  90.1  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  32.9 
 
 
307 aa  90.1  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  23.44 
 
 
348 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  41.13 
 
 
463 aa  89.4  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
308 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.26 
 
 
475 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  32.05 
 
 
257 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  39.63 
 
 
335 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  36.49 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  38.84 
 
 
523 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>