More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4480 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  100 
 
 
340 aa  688    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  49.51 
 
 
321 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  51.85 
 
 
342 aa  285  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  39.04 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  33.23 
 
 
327 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  32.98 
 
 
394 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.6 
 
 
332 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  59.13 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  60 
 
 
459 aa  163  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  33.89 
 
 
337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  33.43 
 
 
337 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  30.7 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  34.83 
 
 
348 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  35.48 
 
 
323 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  31.5 
 
 
345 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  32.3 
 
 
323 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  31.29 
 
 
315 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  32.4 
 
 
331 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  31.92 
 
 
330 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  34.52 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  34.6 
 
 
333 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  30.68 
 
 
372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  30.68 
 
 
372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  32.67 
 
 
319 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  56.03 
 
 
438 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  30.23 
 
 
334 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  54.78 
 
 
452 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  31.48 
 
 
372 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  29.21 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  31.78 
 
 
388 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  32.87 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  30.16 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  27.52 
 
 
348 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  30.3 
 
 
363 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  31.1 
 
 
348 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  55.36 
 
 
235 aa  132  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  29.16 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  30.06 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  29.67 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  31.4 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  31.1 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  30.92 
 
 
361 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  30.92 
 
 
361 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  30.03 
 
 
366 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  36.96 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  43.15 
 
 
388 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  31.73 
 
 
363 aa  126  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  49.09 
 
 
531 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  30.83 
 
 
348 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  44.95 
 
 
378 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  29.12 
 
 
373 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  28.19 
 
 
330 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  50 
 
 
392 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  29.41 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  48.28 
 
 
162 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  46.61 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  36.76 
 
 
517 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  29.39 
 
 
446 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  46.28 
 
 
501 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  52.63 
 
 
337 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  47.29 
 
 
458 aa  113  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  29.46 
 
 
363 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  48.21 
 
 
388 aa  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  37.99 
 
 
367 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.18 
 
 
222 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  48.42 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  42.37 
 
 
432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  45 
 
 
475 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  47.41 
 
 
281 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  45 
 
 
475 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  45 
 
 
475 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  45.79 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  47 
 
 
453 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  33.06 
 
 
374 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  35.11 
 
 
368 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  42.98 
 
 
467 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
467 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  49.54 
 
 
217 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  46.85 
 
 
467 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
469 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  46.43 
 
 
204 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  45.05 
 
 
469 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  48.96 
 
 
380 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  43.24 
 
 
469 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  43.24 
 
 
469 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
347 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.34 
 
 
329 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
326 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  45.05 
 
 
469 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  46.43 
 
 
393 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  50.5 
 
 
375 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  41.44 
 
 
478 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
472 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  42.34 
 
 
479 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  44.04 
 
 
374 aa  104  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  49 
 
 
368 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  46.08 
 
 
317 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  43.52 
 
 
472 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  48.51 
 
 
437 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  27.13 
 
 
301 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>