More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4463 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  390  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  50.83 
 
 		 217 aa  184  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  49.47 
 
 		 196 aa  174  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  47.94 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  47.94 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  46.39 
 
 		 215 aa  157  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 204 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 206 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  41.87 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  43.43 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  40.93 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  39.79 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 205 aa  120  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 211 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 193 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 193 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  39.88 
 
 		 216 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 208 aa  104  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  33.16 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 213 aa  95.5  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 225 aa  62  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  44.64 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6471  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  42.59 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2823  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>