220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4460 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  100 
 
 
306 aa  609  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  61.39 
 
 
316 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  62.21 
 
 
308 aa  358  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  59.93 
 
 
302 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  63.01 
 
 
307 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  60.4 
 
 
306 aa  348  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  56.25 
 
 
306 aa  344  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  56.19 
 
 
317 aa  340  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  60.74 
 
 
305 aa  340  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  58.63 
 
 
309 aa  336  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  57.05 
 
 
308 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  59.04 
 
 
311 aa  324  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  54.63 
 
 
317 aa  322  7e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  53.72 
 
 
319 aa  318  9e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  56.07 
 
 
308 aa  316  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  54.07 
 
 
318 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  54.07 
 
 
318 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  54.07 
 
 
318 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  57.76 
 
 
311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  54.4 
 
 
320 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  52.77 
 
 
317 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  52.09 
 
 
329 aa  290  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  52.77 
 
 
308 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  48.38 
 
 
306 aa  268  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  50.81 
 
 
309 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  40.92 
 
 
306 aa  245  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  37.83 
 
 
305 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  37.83 
 
 
305 aa  229  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  37.83 
 
 
305 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  37.83 
 
 
305 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  37.83 
 
 
305 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  37.83 
 
 
305 aa  228  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  39.27 
 
 
305 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  37.83 
 
 
305 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  37.83 
 
 
305 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  37.83 
 
 
305 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  36.84 
 
 
305 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  46.56 
 
 
308 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  36.96 
 
 
305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  35.86 
 
 
305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  46.89 
 
 
286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  44.01 
 
 
310 aa  207  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  40.7 
 
 
290 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  36.6 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  38.96 
 
 
307 aa  192  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  41.64 
 
 
331 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  40.91 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  38.38 
 
 
307 aa  182  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  35.53 
 
 
333 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  31.05 
 
 
333 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  31.05 
 
 
333 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  38.16 
 
 
306 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  35.97 
 
 
279 aa  149  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2428  proline dehydrogenase  38.99 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.342567 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  36.96 
 
 
277 aa  146  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  29.96 
 
 
318 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  34.89 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  35.29 
 
 
290 aa  139  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  34.45 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  35.93 
 
 
295 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  36.56 
 
 
278 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  31.68 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  32.82 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  32.01 
 
 
996 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  34.64 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  29.15 
 
 
271 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  31.9 
 
 
323 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.98 
 
 
993 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.23 
 
 
1001 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.26 
 
 
993 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.81 
 
 
991 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.71 
 
 
1001 aa  95.5  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.81 
 
 
1003 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.14 
 
 
1006 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.97 
 
 
1003 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.05 
 
 
1002 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.43 
 
 
990 aa  90.5  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.55 
 
 
1004 aa  89.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.93 
 
 
1004 aa  89.4  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.2 
 
 
1013 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.37 
 
 
991 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.37 
 
 
991 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.66 
 
 
1004 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4428  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.13 
 
 
1040 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  28.16 
 
 
975 aa  82.4  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  29.13 
 
 
1028 aa  79.3  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0169  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.74 
 
 
1039 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0936263  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0375  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.84 
 
 
1049 aa  77  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.696802  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13950  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.94 
 
 
1054 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670701  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0819  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.84 
 
 
1052 aa  76.3  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.89 
 
 
1221 aa  76.3  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04017  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.84 
 
 
1049 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0300  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.66 
 
 
1264 aa  73.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54170  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.91 
 
 
1060 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0555  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.21 
 
 
1055 aa  73.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.637208  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001017  proline dehydrogenase (Proline oxidase)/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.83 
 
 
1043 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1249  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.71 
 
 
1063 aa  72.4  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1114  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.45 
 
 
1032 aa  72.4  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4737  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.19 
 
 
1060 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0103  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.67 
 
 
1046 aa  71.2  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>