More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4455 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
395 aa  754    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  56.39 
 
 
398 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  58.23 
 
 
394 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8341  protein of unknown function DUF214  58.99 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  40.1 
 
 
409 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  38.27 
 
 
405 aa  259  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  39.8 
 
 
407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  40.49 
 
 
405 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  39.07 
 
 
409 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  39.51 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  39.26 
 
 
405 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  36.36 
 
 
409 aa  252  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  38.44 
 
 
405 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  38.2 
 
 
405 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  35.29 
 
 
410 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  41.13 
 
 
405 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  34.8 
 
 
410 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  36.57 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  35.25 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  38.24 
 
 
406 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  36.79 
 
 
409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  36.79 
 
 
409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  34.89 
 
 
409 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  37.13 
 
 
394 aa  242  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  37.41 
 
 
408 aa  242  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  36.91 
 
 
401 aa  239  9e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  40.58 
 
 
412 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  40.76 
 
 
415 aa  236  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  39.04 
 
 
654 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  37.78 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  39.02 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  40.71 
 
 
414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  40.74 
 
 
404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  36.96 
 
 
443 aa  233  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  35.7 
 
 
406 aa  233  5e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  37.91 
 
 
656 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  37.66 
 
 
657 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  36.11 
 
 
392 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  34.15 
 
 
406 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  37.97 
 
 
403 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  40.19 
 
 
410 aa  229  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  37.7 
 
 
418 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  40.1 
 
 
414 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  35.82 
 
 
394 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  36.52 
 
 
406 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  38.33 
 
 
405 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.28 
 
 
663 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  38.33 
 
 
405 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  38.85 
 
 
409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  38.35 
 
 
400 aa  226  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  40.48 
 
 
411 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  37.88 
 
 
663 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  38.2 
 
 
409 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  38.44 
 
 
408 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  34.22 
 
 
406 aa  223  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  37.56 
 
 
399 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  36.75 
 
 
644 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  40.1 
 
 
654 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  38.59 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  36.75 
 
 
657 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  37.38 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  39.11 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  38.61 
 
 
402 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  36.09 
 
 
397 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  38.61 
 
 
402 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  39.42 
 
 
410 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  37.73 
 
 
400 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  40.55 
 
 
401 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  38.6 
 
 
656 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  37.23 
 
 
653 aa  216  8e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  34.95 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  38.29 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  37.14 
 
 
409 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  37.38 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  36.89 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  33.66 
 
 
412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  40 
 
 
400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  39.45 
 
 
400 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  38.44 
 
 
410 aa  212  9e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  36.75 
 
 
402 aa  212  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  34.98 
 
 
400 aa  212  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  38.29 
 
 
420 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0469  protein of unknown function DUF214  34.39 
 
 
405 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  34 
 
 
657 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  36.86 
 
 
402 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3479  protein of unknown function DUF214  39.4 
 
 
399 aa  210  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  38.05 
 
 
420 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  36.01 
 
 
404 aa  210  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  39.41 
 
 
401 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  39.41 
 
 
401 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  37.59 
 
 
400 aa  209  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  34.66 
 
 
417 aa  209  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  34.96 
 
 
402 aa  209  8e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  34.06 
 
 
656 aa  208  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  35.77 
 
 
404 aa  208  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  33.42 
 
 
399 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  36.3 
 
 
654 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  37.53 
 
 
653 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  36.3 
 
 
658 aa  207  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  38.15 
 
 
417 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>