More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4440 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4440  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 
434 aa  839    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  63.7 
 
 
440 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0261  glutamyl-tRNA reductase  60.78 
 
 
435 aa  497  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.719241  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2733  glutamyl-tRNA reductase  53.52 
 
 
477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4372  glutamyl-tRNA reductase  52.24 
 
 
501 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02850  glutamyl-tRNA reductase  53.01 
 
 
443 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.766325  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0485  glutamyl-tRNA reductase  50.85 
 
 
473 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.472188  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0667  glutamyl-tRNA reductase  52.17 
 
 
445 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8326  glutamyl-tRNA reductase  55.96 
 
 
440 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0067  glutamyl-tRNA reductase  51.15 
 
 
455 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00785406  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10520  glutamyl-tRNA reductase  51.95 
 
 
468 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200294  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4580  glutamyl-tRNA reductase  55.09 
 
 
458 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0844  glutamyl-tRNA reductase  51.7 
 
 
456 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0729524  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  52.3 
 
 
447 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0494  glutamyl-tRNA reductase  54.52 
 
 
430 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  52.3 
 
 
447 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  52.3 
 
 
447 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6131  glutamyl-tRNA reductase  49.26 
 
 
476 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6730  glutamyl-tRNA reductase  53.46 
 
 
438 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0238  glutamyl-tRNA reductase  49.77 
 
 
473 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.264008  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1013  glutamyl-tRNA reductase  49.55 
 
 
457 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0741734  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  52.24 
 
 
455 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  51.61 
 
 
455 aa  364  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  48.71 
 
 
448 aa  359  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24410  glutamyl-tRNA reductase  51.04 
 
 
456 aa  354  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.557757  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0617  Glutamyl-tRNA reductase  53.41 
 
 
442 aa  353  4e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.186934  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  40.73 
 
 
446 aa  289  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  35.55 
 
 
464 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  35.07 
 
 
443 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  35.07 
 
 
444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  36.97 
 
 
454 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  35.05 
 
 
444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  35.28 
 
 
444 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  35.05 
 
 
444 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  35.05 
 
 
444 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  35.05 
 
 
444 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  35.05 
 
 
444 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  35.05 
 
 
444 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  38.93 
 
 
436 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  34.58 
 
 
444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  34.58 
 
 
444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  36.26 
 
 
443 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  34.6 
 
 
443 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  37.3 
 
 
434 aa  260  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 
458 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  35.13 
 
 
443 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  37.68 
 
 
441 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  37.2 
 
 
436 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  35.92 
 
 
434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  36.3 
 
 
434 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  35.85 
 
 
434 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  32.78 
 
 
464 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 
434 aa  247  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  34.99 
 
 
421 aa  239  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 
438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  30.88 
 
 
441 aa  233  6e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  36.87 
 
 
458 aa  233  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  31.51 
 
 
448 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  31.51 
 
 
448 aa  232  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  35.7 
 
 
434 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  37.78 
 
 
440 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2071  glutamyl-tRNA reductase  39.1 
 
 
473 aa  224  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0822368  hitchhiker  0.0000218323 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  34.05 
 
 
461 aa  222  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  34.43 
 
 
451 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  32.23 
 
 
428 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  36.56 
 
 
414 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  37.86 
 
 
422 aa  219  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 
428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  31.84 
 
 
428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  34.92 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  34.19 
 
 
420 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  30.52 
 
 
448 aa  211  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  30.66 
 
 
428 aa  210  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0685  glutamyl-tRNA reductase  34.19 
 
 
398 aa  209  6e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.310076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  31.28 
 
 
428 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  33.03 
 
 
438 aa  209  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  34.38 
 
 
450 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  32.65 
 
 
436 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  34.92 
 
 
465 aa  207  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11600  glutamyl-tRNA reductase  33.56 
 
 
464 aa  207  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  34.5 
 
 
422 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  33.73 
 
 
443 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  33.73 
 
 
443 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  32.71 
 
 
425 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  32.94 
 
 
442 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 
426 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  34.27 
 
 
422 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 
430 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1362  glutamyl-tRNA reductase  36.62 
 
 
446 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1459  glutamyl-tRNA reductase  36.62 
 
 
446 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  33.02 
 
 
440 aa  202  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2493  glutamyl-tRNA reductase  36.62 
 
 
446 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  33.89 
 
 
416 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  31.8 
 
 
436 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  33.1 
 
 
443 aa  201  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  30.16 
 
 
431 aa  201  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  30.93 
 
 
422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  33.49 
 
 
420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  32.87 
 
 
442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  32.86 
 
 
432 aa  199  6e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>