More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4306 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  100 
 
 
185 aa  362  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  69.35 
 
 
180 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  68.82 
 
 
180 aa  251  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  63.24 
 
 
178 aa  229  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  63.24 
 
 
178 aa  227  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  62.16 
 
 
178 aa  227  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  65.05 
 
 
179 aa  226  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  64.32 
 
 
179 aa  226  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  61.08 
 
 
178 aa  223  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  61.08 
 
 
177 aa  220  7e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  63.24 
 
 
178 aa  220  9e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  62.37 
 
 
179 aa  220  9e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  61.29 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  63.24 
 
 
178 aa  218  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  62.7 
 
 
178 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  61.29 
 
 
179 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  60.75 
 
 
179 aa  216  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  59.68 
 
 
179 aa  214  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  60.22 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  60.22 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  60.22 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  61.29 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  60.75 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  60.75 
 
 
179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  60.75 
 
 
179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  59.68 
 
 
179 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  59.14 
 
 
180 aa  209  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  57.3 
 
 
178 aa  209  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  59.46 
 
 
178 aa  209  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  58.6 
 
 
180 aa  209  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  60.22 
 
 
179 aa  209  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  58.06 
 
 
179 aa  208  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  58.06 
 
 
179 aa  205  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  57.53 
 
 
180 aa  203  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  60 
 
 
181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  53.76 
 
 
179 aa  191  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  55.68 
 
 
179 aa  188  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  54.05 
 
 
179 aa  187  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  53.23 
 
 
187 aa  185  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  53.51 
 
 
180 aa  184  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  53.23 
 
 
187 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  52.43 
 
 
179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  53.51 
 
 
178 aa  181  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  57.69 
 
 
177 aa  180  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  52.97 
 
 
178 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  51.35 
 
 
179 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  51.35 
 
 
179 aa  178  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  51.89 
 
 
179 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 
182 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  51.89 
 
 
178 aa  177  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  53.26 
 
 
177 aa  176  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 
182 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  51.09 
 
 
179 aa  176  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  52.94 
 
 
180 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  49.73 
 
 
180 aa  175  4e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  49.19 
 
 
178 aa  174  5e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  51.89 
 
 
179 aa  174  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  54.1 
 
 
184 aa  174  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  50.54 
 
 
180 aa  173  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  51.09 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 
179 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  50.54 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  48.39 
 
 
179 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  48.39 
 
 
179 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  49.19 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  51.08 
 
 
180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1241  50S ribosomal protein L6  51.09 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138167  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  46.15 
 
 
177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  48.91 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  46.15 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  50.54 
 
 
179 aa  171  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 
179 aa  170  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  50 
 
 
181 aa  169  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  48.91 
 
 
177 aa  170  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  52.69 
 
 
179 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  49.46 
 
 
182 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  48.35 
 
 
177 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  51.35 
 
 
179 aa  168  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 
178 aa  168  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  48.11 
 
 
178 aa  168  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  48.11 
 
 
178 aa  168  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  48.11 
 
 
179 aa  167  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  49.19 
 
 
179 aa  168  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  46.2 
 
 
179 aa  168  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 
179 aa  167  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  48.65 
 
 
179 aa  167  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  49.46 
 
 
181 aa  167  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
177 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  48.63 
 
 
179 aa  166  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  49.46 
 
 
179 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  47.8 
 
 
177 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 
184 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1852  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 
185 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.668423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  45.6 
 
 
177 aa  166  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  46.7 
 
 
177 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  46.49 
 
 
179 aa  166  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>