More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4305 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  100 
 
 
127 aa  249  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  71.65 
 
 
123 aa  170  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  72.81 
 
 
123 aa  169  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  68.5 
 
 
123 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2672  ribosomal protein L18  63.78 
 
 
127 aa  168  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  73.68 
 
 
124 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  70.8 
 
 
125 aa  165  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  64.57 
 
 
127 aa  164  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  62.99 
 
 
127 aa  164  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  70.27 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  64.23 
 
 
126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  65.32 
 
 
128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  71.54 
 
 
128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  69.81 
 
 
134 aa  160  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  65.81 
 
 
136 aa  159  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17010  LSU ribosomal protein L18P  66.1 
 
 
124 aa  158  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000838424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1102  LSU ribosomal protein L18P  67.72 
 
 
127 aa  158  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0571737 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  66.67 
 
 
134 aa  157  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0578  50S ribosomal protein L18  70.08 
 
 
127 aa  157  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2643  ribosomal protein L18  76.24 
 
 
123 aa  157  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  66.67 
 
 
124 aa  156  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  71.17 
 
 
124 aa  156  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  61.29 
 
 
134 aa  154  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  72.22 
 
 
127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0704  ribosomal protein L18  65 
 
 
127 aa  153  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815408  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  68.52 
 
 
123 aa  152  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1201  50S ribosomal protein L18  59.38 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0426216 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  60.47 
 
 
125 aa  144  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23640  LSU ribosomal protein L18P  69.7 
 
 
128 aa  141  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6598  ribosomal protein L18  62.9 
 
 
132 aa  140  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  60.34 
 
 
120 aa  139  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  63.79 
 
 
121 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  59.83 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  63.48 
 
 
121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  59.83 
 
 
137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  62.18 
 
 
120 aa  137  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0267  ribosomal protein L18  67.68 
 
 
123 aa  137  6e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 
122 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  59.29 
 
 
118 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  60.34 
 
 
120 aa  135  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  59.65 
 
 
120 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  63.16 
 
 
122 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  62.73 
 
 
120 aa  135  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1060  50S ribosomal protein L18  63.11 
 
 
134 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172408  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1031  50S ribosomal protein L18  63.11 
 
 
134 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1048  50S ribosomal protein L18  63.11 
 
 
134 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00198535  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  59.65 
 
 
119 aa  133  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  65.38 
 
 
122 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  65.38 
 
 
122 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  57.14 
 
 
122 aa  131  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  59.32 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  59.32 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  59.65 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10734  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 
122 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00420212  normal  0.645623 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  55 
 
 
124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3907  ribosomal protein L18  67.44 
 
 
129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296534  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4299  ribosomal protein L18  67.44 
 
 
129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51112  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  57.85 
 
 
122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  59.66 
 
 
121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  64.71 
 
 
121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  56.9 
 
 
120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  64.65 
 
 
121 aa  126  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  57.02 
 
 
124 aa  126  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  58.93 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  59.65 
 
 
121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  59.65 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  59.65 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  54.87 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  64.65 
 
 
121 aa  124  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 
120 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  59.09 
 
 
120 aa  124  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 
120 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  59.09 
 
 
120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  59.09 
 
 
120 aa  124  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  54.39 
 
 
124 aa  123  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  59.22 
 
 
122 aa  122  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0438  50S ribosomal protein L18  58.62 
 
 
122 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  57.02 
 
 
118 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 
122 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  53.39 
 
 
120 aa  120  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  63.11 
 
 
116 aa  120  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  58.04 
 
 
122 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
122 aa  120  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  51.67 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  57.43 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  54.78 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  56.14 
 
 
117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  55.36 
 
 
122 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  50.88 
 
 
120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 
116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  58.82 
 
 
120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  55.86 
 
 
121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>