More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4304 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  100 
 
 
205 aa  398  1e-110  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  89.82 
 
 
210 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  88.62 
 
 
210 aa  288  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  88.82 
 
 
200 aa  288  4e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  84.48 
 
 
202 aa  283  1e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  84.39 
 
 
202 aa  281  3e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  85.71 
 
 
200 aa  279  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  84.52 
 
 
205 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  73.96 
 
 
199 aa  265  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  80.49 
 
 
223 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  80.49 
 
 
223 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  80.49 
 
 
223 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  6.81641e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  80.49 
 
 
220 aa  262  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.27793e-05  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  79.88 
 
 
222 aa  262  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  3.82419e-06  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  78.11 
 
 
236 aa  260  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  77.19 
 
 
238 aa  258  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  80 
 
 
215 aa  258  5e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  80 
 
 
215 aa  258  5e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  5.41133e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4490  ribosomal protein S5  85.54 
 
 
204 aa  256  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  79.27 
 
 
225 aa  254  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  6.96393e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  80 
 
 
208 aa  255  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0705  ribosomal protein S5  82.74 
 
 
218 aa  248  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0644  ribosomal protein S5  83.23 
 
 
218 aa  247  8e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.883982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6597  30S ribosomal protein S5  84.12 
 
 
201 aa  246  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3126  ribosomal protein S5  82.74 
 
 
226 aa  246  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2642  ribosomal protein S5  81.4 
 
 
214 aa  246  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04150  30S ribosomal protein S5  86.59 
 
 
209 aa  245  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0604  ribosomal protein S5  80.23 
 
 
218 aa  244  7e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.221884  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29570  SSU ribosomal protein S5P  82.63 
 
 
223 aa  244  9e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.219662  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3906  30S ribosomal protein S5  75.92 
 
 
204 aa  243  2e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497899  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4298  30S ribosomal protein S5  75.92 
 
 
204 aa  243  2e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1724  30S ribosomal protein S5  70.76 
 
 
243 aa  241  5e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00276041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1140  ribosomal protein S5  81.1 
 
 
210 aa  235  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.5558  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0948  ribosomal protein S5  85.26 
 
 
212 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.10743  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23630  SSU ribosomal protein S5P  80.75 
 
 
227 aa  231  4e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20700  SSU ribosomal protein S5P  81.65 
 
 
232 aa  231  4e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.950879  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0268  ribosomal protein S5  69.28 
 
 
233 aa  229  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17000  SSU ribosomal protein S5P  75 
 
 
249 aa  225  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  4.50138e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  67.97 
 
 
166 aa  199  2e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  67.32 
 
 
164 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  66.01 
 
 
166 aa  197  1e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.49284e-05  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  64.02 
 
 
167 aa  192  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  64.71 
 
 
166 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  66.01 
 
 
166 aa  192  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  66.01 
 
 
166 aa  192  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  66.46 
 
 
197 aa  191  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  65.36 
 
 
166 aa  188  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  61.44 
 
 
173 aa  188  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  1.46915e-05 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  66.44 
 
 
179 aa  187  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  6.6757e-06 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0859  ribosomal protein S5  64.29 
 
 
182 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  63.82 
 
 
168 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  65.13 
 
 
168 aa  186  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  61.01 
 
 
168 aa  184  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.23427e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  59.49 
 
 
183 aa  184  6e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 
166 aa  184  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  62.75 
 
 
166 aa  184  1e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  62.75 
 
 
166 aa  184  1e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  8.28927e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  62.75 
 
 
166 aa  184  1e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.20585e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  62.75 
 
 
166 aa  184  1e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.26666e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  62.75 
 
 
166 aa  184  1e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.95354e-09  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  62.75 
 
 
166 aa  184  1e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  62.75 
 
 
166 aa  184  1e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 
166 aa  183  1e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  62.75 
 
 
166 aa  184  1e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.3601e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 
166 aa  183  1e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  62.75 
 
 
166 aa  184  1e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  62.75 
 
 
166 aa  184  1e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  62.09 
 
 
166 aa  183  2e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  8.348e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  62.75 
 
 
166 aa  183  2e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  59.48 
 
 
175 aa  183  2e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  58.19 
 
 
182 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  63.4 
 
 
166 aa  182  4e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  62.75 
 
 
167 aa  181  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  59.87 
 
 
167 aa  180  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.20088e-08  unclonable  6.04487e-11 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  62.75 
 
 
166 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 
168 aa  179  3e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.59388e-08  unclonable  8.56318e-06 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 
166 aa  179  3e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1144  ribosomal protein S5  60.13 
 
 
173 aa  178  4e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  7.88101e-07  normal  0.0120151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 
167 aa  178  5e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.90298e-05  decreased coverage  5.58993e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 
167 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  3.5229e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 
167 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.21956e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 
167 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  3.0102e-12 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 
167 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  64.24 
 
 
162 aa  177  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  56.77 
 
 
165 aa  177  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 
168 aa  177  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  9.08127e-09 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  55.19 
 
 
167 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  61.33 
 
 
173 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  66.44 
 
 
168 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 
167 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  55.36 
 
 
189 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 
168 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.49797e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  62.25 
 
 
162 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 
167 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  3.426e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3507  30S ribosomal protein S5  56.86 
 
 
167 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000462246  hitchhiker  9.28534e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 
167 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 
167 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.81151e-09  hitchhiker  1.27878e-09 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 
167 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  1.54128e-11 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 
167 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  7.86846e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1447  30S ribosomal protein S5  55.36 
 
 
189 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.282808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>