More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4291 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  100 
 
 		 209 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  77.99 
 
 		 208 aa  345  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  77.03 
 
 		 208 aa  341  5e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  76.56 
 
 		 208 aa  339  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  78.95 
 
 		 208 aa  337  8e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  76.08 
 
 		 208 aa  337  9e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  74.64 
 
 		 208 aa  326  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0963  30S ribosomal protein S4  76.56 
 
 		 208 aa  326  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.877521  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0609  30S ribosomal protein S4  74.76 
 
 		 209 aa  326  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.19344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  74.76 
 
 		 209 aa  325  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  76.08 
 
 		 208 aa  323  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  67.46 
 
 		 202 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  61.72 
 
 		 201 aa  252  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  60.77 
 
 		 202 aa  251  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  60.29 
 
 		 208 aa  251  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  59.81 
 
 		 208 aa  247  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  59.33 
 
 		 201 aa  245  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  59.52 
 
 		 208 aa  244  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  59.81 
 
 		 201 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  59.81 
 
 		 201 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  59.81 
 
 		 201 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  58.85 
 
 		 206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  57.42 
 
 		 201 aa  241  6e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  60.29 
 
 		 201 aa  241  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  60.29 
 
 		 201 aa  241  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  57.42 
 
 		 208 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  55.5 
 
 		 208 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  56.94 
 
 		 208 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  55.02 
 
 		 208 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  56.94 
 
 		 208 aa  237  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  54.55 
 
 		 208 aa  236  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  55.5 
 
 		 208 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  57.42 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  57.89 
 
 		 208 aa  235  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  55.02 
 
 		 208 aa  235  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  55.02 
 
 		 208 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  56.94 
 
 		 201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  55.5 
 
 		 208 aa  234  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  54.07 
 
 		 208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  56.19 
 
 		 209 aa  231  6e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  55.5 
 
 		 208 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  55.02 
 
 		 208 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  53.59 
 
 		 208 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  53.59 
 
 		 208 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  53.59 
 
 		 208 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  53.59 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  54.55 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 208 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  56.94 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  55.98 
 
 		 202 aa  227  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 208 aa  224  8e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  54.55 
 
 		 208 aa  223  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0252  RNA-binding S4 domain-containing protein  57.89 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  53.81 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  58.85 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  58.37 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.63 
 
 		 208 aa  220  9e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1497  ribosomal protein S4  57.94 
 
 		 208 aa  218  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0242  30S ribosomal protein S4  59.05 
 
 		 208 aa  217  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  53.81 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0449  30S ribosomal protein S4  56.19 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010581  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 209 aa  207  6e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0425  ribosomal protein S4  54.76 
 
 		 208 aa  206  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  50.72 
 
 		 208 aa  201  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 208 aa  198  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 206 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  48.1 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0523  ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645379  unclonable  0.0000000000198285 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0353  ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152733  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 203 aa  194  8.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  49.77 
 
 		 211 aa  193  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 203 aa  194  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  53.08 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0083  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000323728  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  47.62 
 
 		 203 aa  191  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>