67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4259 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  799  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  54.77 
 
 
388 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  53.86 
 
 
423 aa  352  5e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  52.15 
 
 
428 aa  325  6e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  51.75 
 
 
388 aa  292  8e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  41.5 
 
 
392 aa  278  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  46.43 
 
 
411 aa  265  9e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.82332e-08 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  47.93 
 
 
414 aa  264  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  44.58 
 
 
400 aa  252  9e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  44.78 
 
 
438 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  43.82 
 
 
418 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  40.15 
 
 
412 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  50.71 
 
 
403 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  48.18 
 
 
400 aa  244  2e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  44.64 
 
 
396 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  51.7 
 
 
428 aa  243  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  44.82 
 
 
422 aa  239  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  42.97 
 
 
407 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  47.16 
 
 
396 aa  239  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  50.55 
 
 
411 aa  220  4e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  35.56 
 
 
385 aa  198  1e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  42.47 
 
 
443 aa  178  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  40.9 
 
 
383 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  38.57 
 
 
487 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  35.95 
 
 
477 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  35.98 
 
 
372 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  33.53 
 
 
407 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  34.23 
 
 
399 aa  149  1e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  36.97 
 
 
382 aa  147  2e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  37.13 
 
 
416 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  3.64534e-05 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  37.21 
 
 
381 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  35.84 
 
 
399 aa  142  1e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  35.35 
 
 
412 aa  135  1e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  35.35 
 
 
412 aa  135  1e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  36.8 
 
 
358 aa  134  4e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  36.12 
 
 
369 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  35.82 
 
 
474 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  24.51 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  25.72 
 
 
399 aa  91.3  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  27.17 
 
 
402 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  27.98 
 
 
419 aa  84.3  4e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  27.16 
 
 
420 aa  79.3  1e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  28.4 
 
 
444 aa  79.3  1e-13  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  26.85 
 
 
375 aa  79  1e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  27.48 
 
 
401 aa  76.3  9e-13  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  23.56 
 
 
357 aa  63.5  6e-09  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  24.68 
 
 
407 aa  63.2  9e-09  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  19.15 
 
 
433 aa  59.3  1e-07  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  26.86 
 
 
417 aa  58.5  2e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  24.5 
 
 
431 aa  57.8  4e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  20.05 
 
 
393 aa  57  6e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.52 
 
 
465 aa  50.8  4e-05  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.58 
 
 
442 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  1.1365e-10 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  37.36 
 
 
245 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  25.19 
 
 
394 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  21.77 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0800  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  39.74 
 
 
270 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2751  methyltransferase small  46.15 
 
 
309 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1415  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.16 
 
 
314 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.270918  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34 
 
 
463 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1480  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.59 
 
 
314 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.760634  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3184  methyltransferase small  44.26 
 
 
244 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241453  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2179  methyltransferase small  36.84 
 
 
393 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.41478  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3080  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.59 
 
 
305 aa  43.5  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1468  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.59 
 
 
314 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3963  methyltransferase small  41.57 
 
 
222 aa  43.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  33 
 
 
449 aa  43.1  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>