25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4169 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4169  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  262  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1573  hypothetical protein  69.17 
 
 
124 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0760807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2476  hypothetical protein  48.15 
 
 
123 aa  94.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00155227  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  41.67 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0166  hypothetical protein  38.64 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0585  hypothetical protein  33.59 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0120  hypothetical protein  33.86 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7652  hypothetical protein  35.25 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0036  hypothetical protein  34.65 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2404  hypothetical protein  32.09 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000403861  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2403  hypothetical protein  31.4 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000119394  hitchhiker  0.00120616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  37.86 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1324  hypothetical protein  38.38 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00524213  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2672  hypothetical protein  35.82 
 
 
138 aa  57.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972673  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0943  hypothetical protein  33.59 
 
 
172 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56248  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3898  hypothetical protein  34.75 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4253  hypothetical protein  35.63 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0362  hypothetical protein  29.01 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3507  hypothetical protein  31.43 
 
 
226 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0035  hypothetical protein  28.91 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0711061  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4779  hypothetical protein  33.04 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.52313  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00390  conserved hypothetical protein  29.58 
 
 
287 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5090  hypothetical protein  31.82 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634842  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  29.2 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2822  conserved hypothetical secreted protein  28.57 
 
 
146 aa  43.5  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522545  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>