More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4130 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  62.13 
 
 
510 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  61.54 
 
 
510 aa  637    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  62.75 
 
 
510 aa  656    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  61.83 
 
 
519 aa  636    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  62.65 
 
 
514 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  64.5 
 
 
519 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  62.14 
 
 
516 aa  657    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  60 
 
 
531 aa  640    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  70.99 
 
 
516 aa  728    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  63.91 
 
 
508 aa  655    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13309  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 5 accD5  71.32 
 
 
548 aa  757    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  64.5 
 
 
519 aa  665    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  61.45 
 
 
511 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  67.99 
 
 
534 aa  689    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  70.23 
 
 
527 aa  753    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  82.96 
 
 
534 aa  893    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  73.51 
 
 
529 aa  772    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  65.75 
 
 
513 aa  665    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  62.75 
 
 
510 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  62.75 
 
 
510 aa  642    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  62.01 
 
 
513 aa  637    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  60.47 
 
 
513 aa  635    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  72.22 
 
 
542 aa  745    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1043  carboxyl transferase  68.87 
 
 
549 aa  725    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  60.94 
 
 
517 aa  637    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  64.89 
 
 
519 aa  668    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  76.88 
 
 
537 aa  845    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  68.74 
 
 
516 aa  722    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  76.27 
 
 
531 aa  830    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  61.61 
 
 
510 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  77.8 
 
 
536 aa  839    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  78.36 
 
 
536 aa  861    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  63.69 
 
 
516 aa  679    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  79.89 
 
 
524 aa  856    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  63.88 
 
 
531 aa  684    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  70.99 
 
 
526 aa  759    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  61.25 
 
 
515 aa  644    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  62.52 
 
 
520 aa  657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  71.24 
 
 
531 aa  761    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  61.96 
 
 
510 aa  636    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  61.72 
 
 
528 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  62.92 
 
 
510 aa  649    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  62.55 
 
 
510 aa  647    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  70.95 
 
 
556 aa  754    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  61.54 
 
 
510 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  63.31 
 
 
520 aa  656    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  66.67 
 
 
550 aa  716    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  77.19 
 
 
551 aa  823    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  71.59 
 
 
529 aa  743    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  70.8 
 
 
527 aa  746    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  87.26 
 
 
529 aa  937    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  62.94 
 
 
516 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  79.25 
 
 
546 aa  854    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  100 
 
 
530 aa  1085    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  78.15 
 
 
543 aa  846    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  61.34 
 
 
510 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  63.33 
 
 
510 aa  657    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  78.56 
 
 
541 aa  840    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  62.75 
 
 
510 aa  643    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  72.17 
 
 
532 aa  764    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  79.01 
 
 
540 aa  845    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  62.48 
 
 
513 aa  652    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  70.95 
 
 
556 aa  754    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  62.04 
 
 
515 aa  652    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  65.2 
 
 
518 aa  665    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  70.15 
 
 
542 aa  749    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  61.96 
 
 
510 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  71.4 
 
 
516 aa  719    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  62.16 
 
 
518 aa  640    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  60.98 
 
 
510 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  61.54 
 
 
510 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  62.82 
 
 
510 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  60.86 
 
 
516 aa  638    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  62.75 
 
 
510 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  70.95 
 
 
556 aa  754    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  62.92 
 
 
510 aa  645    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  67.24 
 
 
527 aa  717    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  61.96 
 
 
510 aa  636    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  60.31 
 
 
522 aa  639    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  64.31 
 
 
516 aa  639    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  66.04 
 
 
522 aa  713    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  73.82 
 
 
542 aa  775    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4774  carboxyl transferase  70.26 
 
 
538 aa  755    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  62.35 
 
 
510 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4230  carboxyl transferase  75 
 
 
552 aa  807    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551859  normal  0.395293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  82.12 
 
 
527 aa  877    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  82.64 
 
 
530 aa  909    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  82.15 
 
 
527 aa  874    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  60.62 
 
 
510 aa  634  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  60.67 
 
 
510 aa  631  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  61.25 
 
 
510 aa  632  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  59.1 
 
 
518 aa  633  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1735  carboxyl transferase  61.57 
 
 
510 aa  632  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  57.93 
 
 
514 aa  633  1e-180  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  60.54 
 
 
519 aa  634  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  60.78 
 
 
510 aa  633  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  61.45 
 
 
510 aa  632  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  61.06 
 
 
510 aa  632  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  58.45 
 
 
517 aa  629  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1880  carboxyl transferase  61.57 
 
 
510 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0295366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>