More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4114 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 549 aa  1106    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  44.59 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.55 
 
 		 504 aa  312  9e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.68 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.88 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.71 
 
 		 478 aa  231  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.5 
 
 		 491 aa  226  8e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.09 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.11 
 
 		 468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.43 
 
 		 481 aa  209  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  36.07 
 
 		 481 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.74 
 
 		 480 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  32.11 
 
 		 530 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.98 
 
 		 618 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.19 
 
 		 506 aa  197  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.67 
 
 		 584 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.23 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.62 
 
 		 521 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.91 
 
 		 573 aa  193  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.65 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.49 
 
 		 521 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.62 
 
 		 468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.25 
 
 		 379 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  32.24 
 
 		 734 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.11 
 
 		 516 aa  183  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.2 
 
 		 551 aa  183  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.91 
 
 		 487 aa  181  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.85 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  35.7 
 
 		 417 aa  178  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  35.46 
 
 		 395 aa  177  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.87 
 
 		 699 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.87 
 
 		 699 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.96 
 
 		 701 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.86 
 
 		 540 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.83 
 
 		 625 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.84 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.21 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  28.33 
 
 		 684 aa  171  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.92 
 
 		 390 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.36 
 
 		 320 aa  171  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.97 
 
 		 393 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.75 
 
 		 486 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1852  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  30.63 
 
 		 676 aa  166  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.34 
 
 		 732 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.63 
 
 		 336 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.41 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.86 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  34.29 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  38.65 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.39 
 
 		 409 aa  163  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.31 
 
 		 649 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.74 
 
 		 391 aa  162  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.6 
 
 		 526 aa  161  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.84 
 
 		 545 aa  159  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.2 
 
 		 406 aa  160  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.43 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.81 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.33 
 
 		 560 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.03 
 
 		 687 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.75 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.52 
 
 		 567 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.76 
 
 		 1336 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.03 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.67 
 
 		 522 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  34.14 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.35 
 
 		 365 aa  152  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3959  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.75 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.23 
 
 		 619 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.03 
 
 		 643 aa  150  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.64 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.16 
 
 		 404 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.15 
 
 		 493 aa  148  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.46 
 
 		 307 aa  147  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.41 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.52 
 
 		 414 aa  147  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.41 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.41 
 
 		 490 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.92 
 
 		 306 aa  147  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  35.07 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.1 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.14 
 
 		 493 aa  145  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.04 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3214  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.14 
 
 		 443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235319 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.04 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.61 
 
 		 396 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.393457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  37.39 
 
 		 307 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.75 
 
 		 496 aa  136  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  34.66 
 
 		 296 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.15 
 
 		 311 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  28.23 
 
 		 497 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.8 
 
 		 311 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.8 
 
 		 311 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.25 
 
 		 365 aa  133  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00540  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.14 
 
 		 357 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.916603  normal  0.105126 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0589  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 		 498 aa  131  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.581304 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4652  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.29 
 
 		 717 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 489 aa  128  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.33 
 
 		 434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  32.14 
 
 		 349 aa  126  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.7 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>