143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4104 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  100 
 
 
799 aa  1557  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  52.81 
 
 
761 aa  646  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  44.72 
 
 
706 aa  512  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  44.22 
 
 
705 aa  507  1e-142  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  1.00418e-05 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.27 
 
 
705 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.06 
 
 
691 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  41.43 
 
 
726 aa  485  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.71 
 
 
755 aa  373  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  37.11 
 
 
795 aa  338  3e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  35.73 
 
 
742 aa  338  3e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  36.7 
 
 
735 aa  337  7e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  36.53 
 
 
734 aa  329  1e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.22 
 
 
733 aa  325  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  37.89 
 
 
754 aa  320  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  37.58 
 
 
776 aa  320  9e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  34.49 
 
 
742 aa  318  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.47 
 
 
732 aa  318  3e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.43 
 
 
746 aa  317  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.77 
 
 
813 aa  314  3e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  32.08 
 
 
758 aa  312  2e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.92 
 
 
766 aa  309  2e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.18 
 
 
758 aa  307  4e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.19 
 
 
767 aa  307  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.68 
 
 
757 aa  304  5e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  32.8 
 
 
759 aa  301  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  35.85 
 
 
724 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  35.85 
 
 
724 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  35.72 
 
 
724 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.88 
 
 
741 aa  295  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.87 
 
 
804 aa  295  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.87 
 
 
747 aa  294  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.18 
 
 
748 aa  292  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  35.12 
 
 
874 aa  291  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  35.7 
 
 
726 aa  288  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.61 
 
 
786 aa  288  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  34.78 
 
 
759 aa  285  3e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.15 
 
 
693 aa  283  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  37.73 
 
 
703 aa  282  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  33.38 
 
 
706 aa  274  4e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.22 
 
 
788 aa  268  3e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  33.98 
 
 
771 aa  264  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  36.39 
 
 
750 aa  261  5e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  48.99 
 
 
832 aa  239  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.87 
 
 
659 aa  236  2e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  44.48 
 
 
829 aa  227  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.45 
 
 
645 aa  224  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  44.75 
 
 
765 aa  219  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  33.03 
 
 
716 aa  216  1e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.8 
 
 
715 aa  212  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  30.04 
 
 
680 aa  210  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  31.08 
 
 
695 aa  209  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.98 
 
 
764 aa  206  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  36.38 
 
 
679 aa  201  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.32 
 
 
685 aa  200  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  43.15 
 
 
902 aa  200  1e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  42.2 
 
 
692 aa  198  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  44.88 
 
 
719 aa  198  4e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.48 
 
 
710 aa  188  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  43.48 
 
 
666 aa  187  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  42.37 
 
 
684 aa  185  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  44.41 
 
 
792 aa  183  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.58 
 
 
672 aa  182  3e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.08 
 
 
695 aa  179  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  31.17 
 
 
717 aa  177  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.95 
 
 
724 aa  177  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  39.75 
 
 
727 aa  172  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.78 
 
 
670 aa  171  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  37.58 
 
 
715 aa  163  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.88 
 
 
728 aa  160  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  41.22 
 
 
717 aa  160  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.27 
 
 
732 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  3.37224e-05 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  39.71 
 
 
742 aa  159  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  23.37 
 
 
760 aa  154  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  42.97 
 
 
710 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  31.83 
 
 
706 aa  133  1e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  31.83 
 
 
706 aa  133  1e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  33.98 
 
 
1048 aa  127  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  35.24 
 
 
763 aa  127  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  35.75 
 
 
689 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  35.24 
 
 
763 aa  126  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  35.75 
 
 
689 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.33537e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  35.75 
 
 
689 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.64243e-09 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  35.75 
 
 
689 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  7.8955e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  35.75 
 
 
689 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  1.83326e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  35.29 
 
 
689 aa  126  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.06246e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  35.75 
 
 
689 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.85117e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  34.22 
 
 
755 aa  125  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  34.39 
 
 
691 aa  124  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  35.48 
 
 
703 aa  124  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  34.84 
 
 
691 aa  124  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  34.84 
 
 
691 aa  123  1e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  41.58 
 
 
702 aa  120  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.36 
 
 
861 aa  120  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  31.68 
 
 
702 aa  118  4e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  35.45 
 
 
772 aa  118  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.9 
 
 
716 aa  117  1e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  40.31 
 
 
712 aa  115  2e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  34.25 
 
 
768 aa  115  2e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  37.13 
 
 
753 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.72116e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  31.51 
 
 
787 aa  114  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>