More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4084 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  100 
 
 
112 aa  228  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  62.04 
 
 
108 aa  146  7e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  63.55 
 
 
107 aa  144  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  65.05 
 
 
106 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  66.02 
 
 
107 aa  143  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  60.19 
 
 
108 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  67.96 
 
 
107 aa  141  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  62.62 
 
 
107 aa  140  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  56.31 
 
 
113 aa  137  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  59.6 
 
 
109 aa  135  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  61.76 
 
 
108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  58.65 
 
 
106 aa  134  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  59.41 
 
 
108 aa  134  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  58.33 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  58.33 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  58.33 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  58.33 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  58.33 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  59.22 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  58.33 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  58.33 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  53.27 
 
 
107 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  58.33 
 
 
108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  130  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  57.41 
 
 
108 aa  130  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  57.41 
 
 
108 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  57.41 
 
 
108 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  57.41 
 
 
108 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  57.41 
 
 
108 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  57.41 
 
 
108 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  57.41 
 
 
108 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  54.21 
 
 
107 aa  130  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  57.41 
 
 
146 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  57.41 
 
 
108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  52.34 
 
 
107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  58.65 
 
 
108 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  57.41 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  52.78 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  52.88 
 
 
106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  53.4 
 
 
125 aa  127  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  58.25 
 
 
108 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  52.34 
 
 
107 aa  127  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  55.56 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  55.56 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  50.96 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  52.34 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  60 
 
 
108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  52.34 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  59.57 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  52.34 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  60.2 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  50.47 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  52.34 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  56.48 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  60.19 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  53.27 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  53.27 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  55.14 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  54.63 
 
 
108 aa  124  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  54.63 
 
 
108 aa  124  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  48.15 
 
 
259 aa  125  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  48.62 
 
 
259 aa  124  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  54.63 
 
 
108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  55.14 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  58.25 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  52.34 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  53.54 
 
 
115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  49.53 
 
 
257 aa  124  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  53.4 
 
 
105 aa  124  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  58.25 
 
 
109 aa  124  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  57.28 
 
 
108 aa  123  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  123  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  54.9 
 
 
107 aa  123  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  56.31 
 
 
108 aa  122  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  56.31 
 
 
108 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  50.47 
 
 
124 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  55.56 
 
 
108 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  56.31 
 
 
109 aa  121  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  55.34 
 
 
106 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  55.34 
 
 
106 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  55.24 
 
 
106 aa  121  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  55.34 
 
 
108 aa  121  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  53.4 
 
 
109 aa  121  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>