More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4076 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 331 aa  644    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  36.42 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  41.57 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  38.96 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  39.36 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  42.06 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 328 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  34.8 
 
 		 312 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  35.6 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  35.1 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 308 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  40.71 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  34.2 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  36.04 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4505  transcriptional regulator, LysR family  39.87 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 296 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  38.22 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 313 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  33.76 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  34.42 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  36.01 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17190  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00132066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  33.23 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  31.14 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  36.16 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 301 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  32.25 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  32.25 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  33.6 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  34.53 
 
 		 313 aa  116  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  30.79 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1309  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  34.91 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  31.07 
 
 		 298 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 302 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  34.77 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 295 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1027  transcriptional regulator, LysR family  34.08 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  33.46 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  34.1 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  32.33 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  30.85 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 311 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  32.93 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  26.64 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3621  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4270  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  30.41 
 
 		 288 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  31.89 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4593  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 291 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0384972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>