More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3953 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 292 aa  569  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5592  short chain dehydrogenase  49.59 
 
 		 348 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.23191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5212  short chain dehydrogenase  49.59 
 
 		 348 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5300  short chain dehydrogenase  49.59 
 
 		 348 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  41.39 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  41.39 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12160  short chain dehydrogenase  41.47 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.223019  normal  0.712287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  41.08 
 
 		 291 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38260  short-chain alcohol dehydrogenase  41.46 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 315 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3050  short chain dehydrogenase  43.1 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325921  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1700  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3477  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  45.56 
 
 		 247 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3704  ribitol 2-dehydrogenase  37.91 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0194179  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.432228  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 		 242 aa  119  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14693  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.08 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0243  ribitol dehydrogenase  37.91 
 
 		 242 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.08 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.08 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  37.88 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.08 
 
 		 264 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0268  ribitol dehydrogenase  37.91 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  33.49 
 
 		 255 aa  116  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.08 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.68 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  30.68 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  36.44 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.08 
 
 		 264 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  35.45 
 
 		 247 aa  112  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.68 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  32.77 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1414  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.137125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.07 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 		 272 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2820  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 268 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.88 
 
 		 257 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 268 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7375  ribitol 2-dehydrogenase  34.6 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0554  ribitol 2-dehydrogenase  32.7 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.69 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4032  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4334  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 		 233 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1309  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.38 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  34.38 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4948  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.87 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0413  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.38 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.642509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0520  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.55 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0471693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  33.49 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1096  glucose dehydrogenase  37.75 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0163868 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1323  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2468  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  33.85 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000411328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 279 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 		 248 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0197  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.72 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>