17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3948 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3948  hypothetical protein  100 
 
 
419 aa  855  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6356  transcriptional regulator, XRE family  39.81 
 
 
406 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  29.87 
 
 
565 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  24.89 
 
 
443 aa  57.4  4e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  23.32 
 
 
443 aa  55.5  2e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  26.84 
 
 
443 aa  54.7  3e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  22.8 
 
 
441 aa  53.5  7e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  22.8 
 
 
443 aa  52.8  1e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  43.86 
 
 
444 aa  50.4  5e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0264  hypothetical protein  26.77 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3931  hypothetical protein  23.48 
 
 
445 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00536629  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  42.11 
 
 
444 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  23.92 
 
 
556 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  23.39 
 
 
518 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4607  hypothetical protein  26.06 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7489  hypothetical protein  24.65 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0882714  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  29.17 
 
 
442 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>