160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3854 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  100 
 
 		 336 aa  676    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  35.77 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  40.23 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  37.35 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  37.3 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  36.39 
 
 		 322 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  36.17 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  37.56 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  37.45 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  38.43 
 
 		 405 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  35.66 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  37.73 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  37.23 
 
 		 322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  31.4 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  32.72 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  30.03 
 
 		 795 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  38.69 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  34.14 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  32.13 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  33.76 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  33.71 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.18 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  33.46 
 
 		 314 aa  99  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  31.56 
 
 		 471 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  33.04 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  33.58 
 
 		 451 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  26.16 
 
 		 316 aa  93.2  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  28.29 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  36.67 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  33.05 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  32.57 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.86 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  39.57 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.54 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  33.33 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  32.44 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  27.92 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  25.4 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.54 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.26 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  26.1 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.09 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  30 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  28.5 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  26.6 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  25.57 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  28.81 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  27.18 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  26.22 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  26.22 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  28.83 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  26.22 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  26.88 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  27.16 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  27.76 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0284  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  35.88 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  27.47 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  34.78 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1984  esterase, PHB depolymerase family  26.64 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000502853  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  29.09 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  29.09 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  29.09 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  29.09 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  29.09 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  29.09 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  29.09 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4027  PHB depolymerase family esterase  29.95 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  25.25 
 
 		 544 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6529  hypothetical protein  29.79 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0555425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  25.35 
 
 		 1002 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  27.65 
 
 		 429 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1211  esterase, PHB depolymerase family  27.27 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.21 
 
 		 659 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  31.46 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  28.94 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  27.81 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  27.97 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  26.17 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  32.5 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  27.86 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4602  esterase, PHB depolymerase  28.45 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  28.92 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  31.9 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  25.41 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  26.97 
 
 		 429 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4281  PHB depolymerase family esterase  27.56 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  32.12 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  26.53 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  30.52 
 
 		 419 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  25.21 
 
 		 343 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  30.22 
 
 		 372 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2650  hypothetical protein  30.73 
 
 		 355 aa  53.1  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1969  esterase, PHB depolymerase  28.94 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127109  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  24.62 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  33.93 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3290  esterase, PHB depolymerase family  31.82 
 
 		 450 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0711  esterase, PHB depolymerase  25.78 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.612274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2065  esterase, PHB depolymerase  24.81 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0523522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  27.6 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>