114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3816 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 651 aa  1208    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  40.2 
 
 		 678 aa  304  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  40.48 
 
 		 664 aa  279  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  38 
 
 		 651 aa  279  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  40.82 
 
 		 681 aa  273  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  36.79 
 
 		 687 aa  272  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  35.24 
 
 		 691 aa  269  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  39.79 
 
 		 651 aa  266  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.31 
 
 		 731 aa  261  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  40.58 
 
 		 679 aa  256  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  35.75 
 
 		 692 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  38.56 
 
 		 686 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  37.83 
 
 		 736 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  39.15 
 
 		 719 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  35.14 
 
 		 687 aa  238  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  40.83 
 
 		 671 aa  234  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  36.53 
 
 		 642 aa  229  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  34.56 
 
 		 708 aa  221  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  37.25 
 
 		 711 aa  221  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  35.22 
 
 		 739 aa  219  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  35.86 
 
 		 722 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  30.83 
 
 		 718 aa  217  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  35.9 
 
 		 646 aa  215  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.09 
 
 		 675 aa  214  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  36.58 
 
 		 665 aa  214  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  32.12 
 
 		 697 aa  213  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  36.41 
 
 		 665 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  36.41 
 
 		 665 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  32.27 
 
 		 718 aa  209  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  35.21 
 
 		 708 aa  207  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.64 
 
 		 683 aa  206  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  35.52 
 
 		 641 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  35.52 
 
 		 641 aa  206  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  35.58 
 
 		 637 aa  204  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  34.07 
 
 		 752 aa  202  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  34.88 
 
 		 676 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  38.72 
 
 		 672 aa  194  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  32.08 
 
 		 631 aa  185  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  34.01 
 
 		 632 aa  167  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  31.16 
 
 		 653 aa  155  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  31.53 
 
 		 671 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.87 
 
 		 654 aa  143  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.96 
 
 		 319 aa  123  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  34.8 
 
 		 661 aa  117  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  36.93 
 
 		 322 aa  114  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  35.95 
 
 		 322 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.52 
 
 		 613 aa  108  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  34.19 
 
 		 319 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  33.2 
 
 		 310 aa  97.8  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  32.11 
 
 		 328 aa  94.7  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  30.86 
 
 		 604 aa  89.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  37.01 
 
 		 339 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  31.67 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.85 
 
 		 326 aa  72.8  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  30.6 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  33.12 
 
 		 354 aa  69.7  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  32.08 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  29.03 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.8 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  29.03 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  29.44 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  29.03 
 
 		 326 aa  67  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  29.03 
 
 		 331 aa  67  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  37.58 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  39.2 
 
 		 559 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  27.27 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  28.4 
 
 		 327 aa  60.1  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  28.82 
 
 		 277 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  28.24 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  28.24 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  34.43 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  38.82 
 
 		 663 aa  57.4  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  34.72 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  30.32 
 
 		 254 aa  57  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  27.65 
 
 		 265 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  33.77 
 
 		 551 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  27.85 
 
 		 387 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  27.65 
 
 		 274 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  28.24 
 
 		 277 aa  55.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  33.01 
 
 		 322 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  38.82 
 
 		 588 aa  53.9  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1161  copper resistance D domain protein  35.44 
 
 		 310 aa  53.9  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  37.69 
 
 		 564 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  27.84 
 
 		 332 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  30.77 
 
 		 298 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  32.2 
 
 		 578 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  36.92 
 
 		 565 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.15 
 
 		 290 aa  51.6  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  33.98 
 
 		 869 aa  51.6  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  26.9 
 
 		 547 aa  51.2  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  28.41 
 
 		 316 aa  50.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  25.82 
 
 		 300 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  22.77 
 
 		 544 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  32.77 
 
 		 310 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  27.2 
 
 		 315 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  31.33 
 
 		 317 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  23.49 
 
 		 544 aa  48.9  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  31.6 
 
 		 322 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  29.61 
 
 		 649 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  23.49 
 
 		 549 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>