More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3697 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
252 aa  501  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  76.79 
 
 
242 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  76.92 
 
 
239 aa  358  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  71.24 
 
 
248 aa  352  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  69.23 
 
 
246 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  66.12 
 
 
269 aa  327  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  66.95 
 
 
268 aa  318  7e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  60.26 
 
 
249 aa  287  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  58.55 
 
 
244 aa  274  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  50.65 
 
 
244 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  47.06 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1304  UbiC transcription regulator-associated domain protein  45.65 
 
 
233 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  45.57 
 
 
243 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  44.35 
 
 
246 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
245 aa  185  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  46.75 
 
 
266 aa  184  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  45.02 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 
255 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  45.02 
 
 
264 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  43.67 
 
 
256 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  45.02 
 
 
246 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  40.42 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  41.99 
 
 
245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  41.7 
 
 
243 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  42.98 
 
 
245 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  39.75 
 
 
244 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  41.13 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  40.37 
 
 
238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1316  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
237 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0056  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  40.89 
 
 
232 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
243 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  41.77 
 
 
252 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
244 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
225 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  39.48 
 
 
247 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  40.17 
 
 
254 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
241 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
239 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
241 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  39.66 
 
 
278 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  37.87 
 
 
252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 
242 aa  145  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
240 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  40.18 
 
 
255 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
195 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
195 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 
286 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
195 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.64 
 
 
272 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  40.44 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  39.61 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  42.45 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.8 
 
 
255 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  39.13 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 
249 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
242 aa  126  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4184  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
185 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000338347  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
260 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
260 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
238 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
260 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 
245 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05080  transcriptional regulator  37.98 
 
 
259 aa  123  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.764166  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
248 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
219 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
245 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  38.33 
 
 
246 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 
259 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  33.48 
 
 
239 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
246 aa  121  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 
245 aa  121  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.86 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  34.3 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  34.3 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.97 
 
 
242 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.8 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  33.04 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  33.82 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.8 
 
 
243 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
240 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.6 
 
 
263 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
243 aa  118  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 
253 aa  118  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  38.15 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.596979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>