More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3655 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
332 aa  661    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  62.5 
 
 
339 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  48.01 
 
 
337 aa  292  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  45.85 
 
 
348 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  44.62 
 
 
368 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  44.48 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  41.64 
 
 
363 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  39.82 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  39.81 
 
 
346 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 
325 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  35.65 
 
 
354 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.95 
 
 
346 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  31 
 
 
328 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  35.76 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 
323 aa  156  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  33.96 
 
 
322 aa  152  7e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  35.22 
 
 
324 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  27.9 
 
 
325 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 
320 aa  149  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  29.97 
 
 
324 aa  149  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 
350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  30.91 
 
 
322 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  29.84 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  33.02 
 
 
366 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 
331 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
310 aa  136  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  33.97 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  33.74 
 
 
352 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 
862 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 
329 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  33.44 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  30.59 
 
 
335 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  30.75 
 
 
353 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  29.32 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  33.23 
 
 
342 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  31.64 
 
 
357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  31.38 
 
 
359 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  28.06 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  32.39 
 
 
374 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  30.58 
 
 
359 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  27.69 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  29.38 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  30.42 
 
 
359 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  29.91 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  33.57 
 
 
361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  30 
 
 
341 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  32.82 
 
 
359 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  29.25 
 
 
359 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  28.04 
 
 
337 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 
348 aa  106  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 
365 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 
334 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  30.25 
 
 
349 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 
344 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  31.27 
 
 
366 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  28.31 
 
 
321 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  31.6 
 
 
357 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  34.72 
 
 
326 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 
400 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  29.94 
 
 
329 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 
359 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 
371 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  33.21 
 
 
383 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  33.21 
 
 
331 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  33.21 
 
 
359 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  29.94 
 
 
349 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  30.61 
 
 
394 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  33.21 
 
 
359 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.84 
 
 
352 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  33.21 
 
 
359 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 
354 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  33.21 
 
 
359 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.21 
 
 
359 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  28.96 
 
 
355 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  33.96 
 
 
362 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 
334 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 
334 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
335 aa  99.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 
328 aa  99.8  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 
359 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 
359 aa  99.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 
357 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.22 
 
 
357 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 
356 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  31.42 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000948581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  29.6 
 
 
354 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  27.84 
 
 
317 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  28.2 
 
 
354 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  27.94 
 
 
354 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  25.72 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 
349 aa  96.3  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  31.08 
 
 
324 aa  95.9  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4168  beta-lactamase domain protein  30.31 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  28.66 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>