17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3628 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3628  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  629  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3630  helix-turn-helix domain protein  90 
 
 
429 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.904143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3629  hypothetical protein  89.06 
 
 
320 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.905259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4654  helix-turn-helix domain protein  48.93 
 
 
431 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4652  hypothetical protein  49.23 
 
 
339 aa  248  7e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  47.85 
 
 
455 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3627  hypothetical protein  90.62 
 
 
128 aa  212  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  40.25 
 
 
444 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  39.01 
 
 
444 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3484  XRE family transcriptional regulator  29.27 
 
 
439 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 
442 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  29.52 
 
 
556 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  30.48 
 
 
545 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  26.84 
 
 
518 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0275  hypothetical protein  36.55 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.484738  normal  0.794868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  34.53 
 
 
505 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7615  hypothetical protein  26.47 
 
 
477 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.706706  normal  0.998614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>