14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3627 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3627  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  251  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3629  hypothetical protein  96.09 
 
 
320 aa  216  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.905259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3630  helix-turn-helix domain protein  90.62 
 
 
429 aa  206  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.904143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3628  hypothetical protein  90.62 
 
 
320 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4655  hypothetical protein  54.69 
 
 
455 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4652  hypothetical protein  55.47 
 
 
339 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4654  helix-turn-helix domain protein  52.21 
 
 
431 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0952  hypothetical protein  41.6 
 
 
444 aa  89.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4891  hypothetical protein  39.2 
 
 
444 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  31.53 
 
 
545 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3484  XRE family transcriptional regulator  33.59 
 
 
439 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  32.43 
 
 
556 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  29.73 
 
 
518 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1672  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 
442 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000955969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>