210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3620 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 99 aa  190  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  85.86 
 
 		 99 aa  170  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  51.52 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  54.76 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  52.78 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  42.7 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  35.37 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  38.55 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  35 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 117 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 186 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.67 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2542  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.054294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  51.02 
 
 		 179 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 77 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  36.36 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  48.98 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  55.36 
 
 		 503 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  46.94 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  47.83 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  37.21 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  31.82 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  31.82 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  32.18 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.67 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1909  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 513 aa  47  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2246  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  41.1 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 266 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 252 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  48.15 
 
 		 516 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  30.51 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  35.94 
 
 		 383 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  39.68 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  30.51 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  30.51 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  30.51 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  30.51 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 364 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 346 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  42.62 
 
 		 465 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  28.36 
 
 		 192 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  36.92 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 359 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1388  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  42.31 
 
 		 255 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 184 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5917  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.35 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19317  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 184 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 196 aa  43.5  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 125 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  44.44 
 
 		 196 aa  43.5  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  34.83 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  41.82 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  37.74 
 
 		 233 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>