208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3551 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  72.67 
 
 
175 aa  242  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  62.43 
 
 
194 aa  217  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  62.43 
 
 
202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  60.57 
 
 
179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  54.63 
 
 
200 aa  203  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  61.27 
 
 
222 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  52.81 
 
 
204 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  57.53 
 
 
242 aa  165  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  44.71 
 
 
194 aa  142  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  36.16 
 
 
174 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  38.98 
 
 
174 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  35.63 
 
 
168 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  40.37 
 
 
183 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  37.5 
 
 
174 aa  98.6  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 
174 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
170 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  36.31 
 
 
174 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  35.29 
 
 
168 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  36.63 
 
 
175 aa  91.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  35.96 
 
 
177 aa  88.2  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  36.05 
 
 
178 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  34.46 
 
 
176 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  33.14 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  46.99 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  34.27 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  31.68 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  44.71 
 
 
184 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  33.93 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  31.79 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  31.61 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  35.11 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  40.96 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  42.5 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  29.83 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  32.06 
 
 
179 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  32.06 
 
 
179 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  34.51 
 
 
187 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
181 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  35.96 
 
 
179 aa  61.6  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  35.19 
 
 
184 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
183 aa  61.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  27.22 
 
 
185 aa  61.6  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  38.89 
 
 
175 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  30.29 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  34.65 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  31.55 
 
 
176 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 
172 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  36.94 
 
 
179 aa  59.3  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  39.64 
 
 
196 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
185 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
196 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  39.64 
 
 
185 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  30.06 
 
 
182 aa  58.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  21.14 
 
 
184 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
195 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3673  PadR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  34.31 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  36.59 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  39.51 
 
 
174 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  33.15 
 
 
184 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  26.9 
 
 
165 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  28.49 
 
 
181 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  23.31 
 
 
183 aa  55.8  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5591  PadR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
196 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  26.9 
 
 
165 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  26.9 
 
 
165 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  26.9 
 
 
165 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  26.9 
 
 
165 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 
177 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  31.58 
 
 
176 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  28.02 
 
 
189 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  34.15 
 
 
305 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  36.84 
 
 
165 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  38.82 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  38.82 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  38.36 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  26.16 
 
 
186 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  38.82 
 
 
183 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  37.5 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  29.25 
 
 
325 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  31.54 
 
 
182 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  26.92 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
192 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  35.58 
 
 
198 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  30.97 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 
334 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  39.51 
 
 
183 aa  52  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  42.25 
 
 
263 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  33.01 
 
 
277 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  35.58 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  33.72 
 
 
203 aa  51.6  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  35.16 
 
 
114 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  22.67 
 
 
179 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  31.36 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>