More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3475 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
524 aa  1045    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.24 
 
 
510 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.53 
 
 
526 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  51.93 
 
 
552 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.3 
 
 
546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.74 
 
 
506 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.74 
 
 
506 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.74 
 
 
506 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  49.9 
 
 
523 aa  464  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  49.9 
 
 
510 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.97 
 
 
483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.87 
 
 
512 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.95 
 
 
528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.97 
 
 
483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.4 
 
 
507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.29 
 
 
490 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.78 
 
 
483 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.97 
 
 
523 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.85 
 
 
477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  49.71 
 
 
512 aa  445  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  50.88 
 
 
508 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 
510 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 
478 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  49.71 
 
 
511 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  49.8 
 
 
489 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  43.65 
 
 
533 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  42.1 
 
 
522 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  42.29 
 
 
543 aa  355  8.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  38.73 
 
 
549 aa  350  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  38.92 
 
 
549 aa  349  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  37.66 
 
 
552 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  42.43 
 
 
545 aa  343  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  37.57 
 
 
560 aa  343  5.999999999999999e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  39.51 
 
 
630 aa  339  8e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  37.1 
 
 
550 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  37.8 
 
 
552 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  37.29 
 
 
544 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 
553 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  37.09 
 
 
518 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  36.64 
 
 
548 aa  334  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  36.87 
 
 
560 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  36.89 
 
 
570 aa  330  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  37.14 
 
 
557 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  36.75 
 
 
560 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  36.55 
 
 
578 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  36.77 
 
 
549 aa  324  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  36.06 
 
 
549 aa  324  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  36.38 
 
 
560 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  37.55 
 
 
572 aa  323  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  36.98 
 
 
557 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 
562 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  39.44 
 
 
564 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 
554 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  38.03 
 
 
539 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  35.38 
 
 
565 aa  321  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  38.09 
 
 
576 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  38.69 
 
 
564 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 
566 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  36.47 
 
 
571 aa  319  7e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  35.2 
 
 
548 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  37.03 
 
 
564 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 
566 aa  317  3e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  37.96 
 
 
561 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  37.94 
 
 
564 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  37.74 
 
 
518 aa  316  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  35.03 
 
 
560 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  37.69 
 
 
576 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  35.13 
 
 
587 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  37.22 
 
 
549 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  36.52 
 
 
576 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  37.71 
 
 
576 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  36.29 
 
 
562 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  37.71 
 
 
570 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  37.71 
 
 
576 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  37.71 
 
 
576 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  37.71 
 
 
576 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  37.27 
 
 
576 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  37.71 
 
 
576 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 
525 aa  314  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  35.9 
 
 
571 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 
843 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  36.84 
 
 
550 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  37.2 
 
 
576 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  35.9 
 
 
571 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  35.4 
 
 
552 aa  310  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4137  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 
554 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  35.73 
 
 
557 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  38.56 
 
 
549 aa  307  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 
513 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  34.76 
 
 
552 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  36.59 
 
 
561 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.24 
 
 
513 aa  306  6e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  36.55 
 
 
575 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  34.85 
 
 
549 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  35.89 
 
 
576 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.02 
 
 
579 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  38.43 
 
 
565 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  37.74 
 
 
540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  34.34 
 
 
547 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  37.28 
 
 
538 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>