More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3409 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 278 aa  559  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  69.42 
 
 		 278 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  67.63 
 
 		 278 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  66.55 
 
 		 277 aa  370  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  64.39 
 
 		 277 aa  354  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  61.73 
 
 		 276 aa  347  9e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  64.26 
 
 		 276 aa  347  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  63.8 
 
 		 272 aa  333  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  61.15 
 
 		 271 aa  324  7e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  62.41 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  60.99 
 
 		 275 aa  320  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  58.63 
 
 		 271 aa  318  7e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  56.52 
 
 		 275 aa  308  6.999999999999999e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  58.84 
 
 		 270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2210  elongation factor Ts  59.71 
 
 		 271 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.126056  normal  0.227569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12903  elongation factor Ts  61.51 
 
 		 271 aa  297  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.172192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2105  translation elongation factor Ts  58.01 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2040  elongation factor Ts  60.5 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4132  elongation factor Ts  59.71 
 
 		 271 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.367953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1994  elongation factor Ts  60.5 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1975  elongation factor Ts  60.5 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1669  translation elongation factor Ts  58.57 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  53.05 
 
 		 282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3112  translation elongation factor Ts  55.91 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959082  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  52.86 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1485  translation elongation factor Ts  53.74 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.485707  normal  0.476754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  51.79 
 
 		 278 aa  276  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  51.43 
 
 		 278 aa  274  9e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  50.36 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1005  translation elongation factor Ts  50.9 
 
 		 279 aa  268  5.9999999999999995e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3242  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  54.87 
 
 		 270 aa  262  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388242  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10130  elongation factor Ts  46.79 
 
 		 274 aa  248  9e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2506  elongation factor Ts  49.82 
 
 		 281 aa  247  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.346339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1181  translation elongation factor Ts  49.29 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.875084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  43.93 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  43.21 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0404  elongation factor Ts  44.13 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000167696  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  44.24 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 292 aa  212  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  43.37 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  43.17 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  44.6 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  44.6 
 
 		 293 aa  209  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  43.17 
 
 		 293 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1405  elongation factor Ts  43.32 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  44.6 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  44.6 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  44.6 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  44.6 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  44.6 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  43.88 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  43.88 
 
 		 293 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  43.88 
 
 		 293 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  44.6 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  43.88 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  44.6 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  43.88 
 
 		 293 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  42.45 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  43.53 
 
 		 293 aa  205  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4947  elongation factor Ts  43.26 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725699 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1880  elongation factor Ts  41.73 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  42.86 
 
 		 277 aa  198  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  41.01 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  39.71 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  44.09 
 
 		 293 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  40.75 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1224  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0842617  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2584  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.958437  normal  0.0691199 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  42.5 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  39.04 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  41.73 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1824  elongation factor Ts  42.2 
 
 		 298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.31491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  42.21 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1279  elongation factor Ts  42.24 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.174908 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  44.09 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  42.5 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  40.2 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  37.07 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  41.87 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  41.94 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  40.88 
 
 		 291 aa  188  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  39.73 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  41.64 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  40.58 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.3 
 
 		 278 aa  186  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  40.61 
 
 		 288 aa  186  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  41.16 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  42.47 
 
 		 303 aa  185  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  39.93 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0627  translation elongation factor Ts  41.16 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.897775  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  43.21 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  39.43 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  38.64 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  40.99 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  41.45 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1343  elongation factor Ts  41.43 
 
 		 296 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.284901 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  39.21 
 
 		 291 aa  181  9.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  39.32 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  39.02 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>