More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3392 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
464 aa  931    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  66.81 
 
 
464 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  68.12 
 
 
473 aa  632  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  67.46 
 
 
464 aa  625  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  64.22 
 
 
459 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  60.35 
 
 
480 aa  540  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  56.49 
 
 
477 aa  494  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  57.14 
 
 
468 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  57.88 
 
 
471 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  57.14 
 
 
468 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  58.94 
 
 
443 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  54.35 
 
 
487 aa  477  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  56.16 
 
 
477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  44.28 
 
 
470 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  48.89 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  44.23 
 
 
463 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  42.39 
 
 
483 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 
486 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  37.36 
 
 
465 aa  350  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 
472 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 
466 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 
496 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  35.76 
 
 
454 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 
465 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 
473 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  33.84 
 
 
465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 
462 aa  190  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  33.41 
 
 
466 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 
460 aa  189  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 
460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 
460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 
456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 
456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  35.18 
 
 
466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 
456 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 
473 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  32.68 
 
 
465 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 
460 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
462 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 
437 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  32.67 
 
 
460 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
486 aa  182  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  32.06 
 
 
437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 
482 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 
466 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
464 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 
462 aa  177  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 
463 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
521 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 
462 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 
464 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 
472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  28.91 
 
 
466 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  31.69 
 
 
462 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
462 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 
463 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
457 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  30.61 
 
 
462 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 
491 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  32.05 
 
 
470 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  31.76 
 
 
439 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  31.22 
 
 
480 aa  169  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  32.21 
 
 
463 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 
425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 
465 aa  167  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  31.22 
 
 
462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 
444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  31.32 
 
 
439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 
463 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 
463 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 
436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  30.36 
 
 
466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  31.76 
 
 
424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  31.22 
 
 
463 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 
425 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 
475 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  33.67 
 
 
431 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  30.99 
 
 
463 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 
437 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 
491 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  33.1 
 
 
427 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 
430 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
469 aa  160  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 
444 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 
472 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
468 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  32.13 
 
 
435 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
431 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
476 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 
431 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
426 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
468 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
425 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
464 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  32.86 
 
 
427 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  32.27 
 
 
438 aa  157  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>