55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3354 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  100 
 
 
151 aa  301  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  68.67 
 
 
150 aa  216  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  67.57 
 
 
153 aa  204  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  65.73 
 
 
157 aa  200  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  65.77 
 
 
151 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  62.67 
 
 
150 aa  193  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  61.74 
 
 
150 aa  192  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  60.81 
 
 
151 aa  184  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  60.67 
 
 
150 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  60.69 
 
 
152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  60.14 
 
 
150 aa  176  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  59.86 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  59.86 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  60.14 
 
 
146 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  50.66 
 
 
153 aa  143  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  49.32 
 
 
150 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  49.32 
 
 
150 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  47.3 
 
 
153 aa  131  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  45.91 
 
 
165 aa  124  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  47.3 
 
 
154 aa  121  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  41.89 
 
 
153 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  39.46 
 
 
154 aa  101  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  38.62 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  58.23 
 
 
120 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  56.96 
 
 
82 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  40.4 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  40.8 
 
 
163 aa  87.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.4 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.6 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.4 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.6 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2335  hypothetical protein  61.19 
 
 
71 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478676  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.8 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  58.82 
 
 
86 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.12 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  41.6 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.88 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.88 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.27 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.8 
 
 
193 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  34.92 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.14 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  34.21 
 
 
162 aa  63.5  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  38.75 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2092  hypothetical protein  52.54 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0956237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  31.51 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.62 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  28.12 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  28.12 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  30.38 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  33.33 
 
 
431 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0643  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  36.99 
 
 
172 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.26 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2319  hypothetical protein  73.91 
 
 
343 aa  40.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>