More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3351 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3351  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 445 aa  874    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0411175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3925  Glycine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 417 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  decreased coverage  0.00651172 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0346  serine hydroxymethyltransferase  38.4 
 
 		 431 aa  301  2e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0045  serine hydroxymethyltransferase  42.64 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0231458 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1090  serine hydroxymethyltransferase  43.48 
 
 		 430 aa  288  2e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0929  Glycine hydroxymethyltransferase  42.93 
 
 		 440 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.802509  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0014  serine hydroxymethyltransferase  42.39 
 
 		 430 aa  286  7e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1611  Glycine hydroxymethyltransferase  37.73 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2079  serine hydroxymethyltransferase  40 
 
 		 445 aa  275  8e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.172467  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0048  serine hydroxymethyltransferase  40.98 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1650  serine hydroxymethyltransferase  38.1 
 
 		 431 aa  273  5.000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0061  Glycine hydroxymethyltransferase  35.54 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1793  serine hydroxymethyltransferase  34.91 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1046  serine hydroxymethyltransferase  34.56 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0271  Glycine hydroxymethyltransferase  39.38 
 
 		 358 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  30.86 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  32.93 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  34.22 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5063  serine hydroxymethyltransferase  32.8 
 
 		 424 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0644659  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  32.5 
 
 		 424 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  30.81 
 
 		 422 aa  175  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  33.5 
 
 		 421 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  32.45 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  29.54 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3135  serine hydroxymethyltransferase  33.51 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  32.2 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  34.15 
 
 		 433 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  33.25 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  33.25 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  33.25 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  32.82 
 
 		 424 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  33.69 
 
 		 434 aa  172  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3844  serine hydroxymethyltransferase  32 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.988817  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4508  serine hydroxymethyltransferase  31.59 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0218  serine hydroxymethyltransferase  31.04 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0240245  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4270  serine hydroxymethyltransferase  36.2 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978969  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  32.2 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  32.31 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0710  serine hydroxymethyltransferase  33.01 
 
 		 424 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  33.09 
 
 		 414 aa  170  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1979  serine hydroxymethyltransferase  33.01 
 
 		 424 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00954911  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0471  serine hydroxymethyltransferase  33.01 
 
 		 424 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1006  serine hydroxymethyltransferase  33.01 
 
 		 424 aa  170  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  31.8 
 
 		 424 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  35.01 
 
 		 420 aa  170  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0796  serine hydroxymethyltransferase  33.25 
 
 		 416 aa  170  5e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  32.99 
 
 		 412 aa  169  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  31.54 
 
 		 424 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  31.59 
 
 		 413 aa  169  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  32.38 
 
 		 411 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5200  serine hydroxymethyltransferase  31.8 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  32.14 
 
 		 417 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5085  serine hydroxymethyltransferase  31.8 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  32.14 
 
 		 417 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  30.69 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0571  serine hydroxymethyltransferase  31.54 
 
 		 424 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  32.16 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  31.99 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  33.41 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  31.89 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  33.75 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  30.39 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0311  serine hydroxymethyltransferase  29.88 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  30.03 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  32.89 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3283  serine hydroxymethyltransferase  31.55 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  31.54 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  30.81 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  32.38 
 
 		 431 aa  167  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  31.07 
 
 		 413 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  31.07 
 
 		 413 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  31.89 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  35.83 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  33.24 
 
 		 424 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  32.75 
 
 		 413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 508 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  31.44 
 
 		 439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  31.07 
 
 		 413 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  32.38 
 
 		 410 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  30.15 
 
 		 414 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  30.15 
 
 		 414 aa  166  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  31.87 
 
 		 417 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  30.81 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0952  serine hydroxymethyltransferase  31.99 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  30.81 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  31.83 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  32.05 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  31.52 
 
 		 438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  31.19 
 
 		 413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  31.05 
 
 		 424 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  31.89 
 
 		 417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  32.72 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  32.72 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  32.7 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  31.46 
 
 		 417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  32.79 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  33.5 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  30.81 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>