238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3318 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
228 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4244  uracil-DNA glycosylase  65.93 
 
 
232 aa  310  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106427  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3854  uracil-DNA glycosylase  66.37 
 
 
233 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  65.91 
 
 
245 aa  279  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  54.34 
 
 
225 aa  257  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  53.88 
 
 
225 aa  254  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  54.05 
 
 
225 aa  254  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  54.05 
 
 
225 aa  254  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  53.6 
 
 
225 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  52.7 
 
 
225 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  53.15 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  53.15 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  53.15 
 
 
225 aa  252  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  53.6 
 
 
225 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  53.15 
 
 
225 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  53.67 
 
 
226 aa  247  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  53.99 
 
 
220 aa  246  3e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  53.88 
 
 
226 aa  242  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  51.61 
 
 
221 aa  241  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  53.39 
 
 
225 aa  241  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 
225 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  52.44 
 
 
229 aa  235  4e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  51.17 
 
 
221 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  52.94 
 
 
224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  49.11 
 
 
222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  50.7 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  52.49 
 
 
229 aa  231  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  50.44 
 
 
227 aa  230  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  48.39 
 
 
221 aa  229  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  56.44 
 
 
218 aa  228  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0897  uracil-DNA glycosylase  51.79 
 
 
229 aa  227  1e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
225 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
225 aa  224  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  58.38 
 
 
225 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  50.47 
 
 
224 aa  224  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
223 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 
269 aa  223  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  54.42 
 
 
217 aa  223  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000282189  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3740  uracil-DNA glycosylase  55.15 
 
 
216 aa  222  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000022896  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2096  uracil-DNA glycosylase  53.57 
 
 
229 aa  221  7e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  49.09 
 
 
245 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  48.2 
 
 
247 aa  219  3e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  50.9 
 
 
232 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 
231 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 
231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  50.22 
 
 
229 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  57.84 
 
 
225 aa  217  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  48.83 
 
 
221 aa  217  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  51.8 
 
 
233 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  55.91 
 
 
226 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  47.75 
 
 
225 aa  216  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10973  putative uracil-DNA glycosylase  47.56 
 
 
221 aa  216  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  49.34 
 
 
231 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  55.16 
 
 
226 aa  215  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  54.01 
 
 
223 aa  215  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3221  uracil-DNA glycosylase  49.08 
 
 
221 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00088309  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 
229 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3654  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  48.13 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  54.55 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  56.99 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  56.99 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0893  uracil-DNA glycosylase  48.62 
 
 
219 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00328532  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  48.46 
 
 
268 aa  212  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3129  uracil-DNA glycosylase  48.62 
 
 
219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000726683  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  52.2 
 
 
243 aa  211  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  55.38 
 
 
226 aa  211  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1156  uracil-DNA glycosylase  50.47 
 
 
217 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
230 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1283  uracil-DNA glycosylase  52.76 
 
 
216 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0138995  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  45.87 
 
 
223 aa  210  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0977  uracil-DNA glycosylase  48.62 
 
 
221 aa  209  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00168707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  56.63 
 
 
227 aa  209  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000721221  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  54.59 
 
 
228 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  51.24 
 
 
222 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3073  uracil-DNA glycosylase  47.25 
 
 
222 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.906111  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 
230 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  49.56 
 
 
230 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  56.22 
 
 
228 aa  208  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 
241 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  46.9 
 
 
232 aa  208  6e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  53.76 
 
 
221 aa  207  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  48.65 
 
 
241 aa  207  9e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  49.54 
 
 
221 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2551  uracil-DNA glycosylase  55.14 
 
 
224 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4288  uracil-DNA glycosylase  53.68 
 
 
225 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  50 
 
 
230 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1034  uracil-DNA glycosylase  51.5 
 
 
221 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000379797  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  47.2 
 
 
235 aa  206  3e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1067  uracil-DNA glycosylase  51.5 
 
 
221 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000655251  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 
237 aa  205  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  49.11 
 
 
230 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3325  uracil-DNA glycosylase  51.5 
 
 
221 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00364236  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0965  uracil-DNA glycosylase  51 
 
 
221 aa  204  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0201981  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  54.59 
 
 
230 aa  204  8e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3091  uracil-DNA glycosylase  48.18 
 
 
220 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>