More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3251 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3251  protein of unknown function DUF558  100 
 
 		 244 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.131486  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1152  hypothetical protein  64.78 
 
 		 246 aa  293  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.920301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2291  hypothetical protein  62.7 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0703  protein of unknown function DUF558  57.32 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0840  hypothetical protein  56.63 
 
 		 248 aa  249  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.240115  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1573  protein of unknown function DUF558  57.85 
 
 		 259 aa  245  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.475919  normal  0.0145737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1243  protein of unknown function DUF558  55.51 
 
 		 244 aa  224  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.291917  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1905  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  57.66 
 
 		 246 aa  221  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208469  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3454  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  56.91 
 
 		 244 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3834  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  56.1 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3458  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  50.61 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3521  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  50.61 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3469  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  50.61 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00733732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7056  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  56.15 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.772012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1645  protein of unknown function DUF558  54.67 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3835  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  50.21 
 
 		 246 aa  204  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2703  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  51.85 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0785  hypothetical protein  53.23 
 
 		 250 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.626283  normal  0.0546627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2111  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  56.89 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3161  protein of unknown function DUF558  48.39 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2190  protein of unknown function DUF558  49.22 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13450  conserved hypothetical protein TIGR00046  47.08 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.959245  normal  0.237333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1548  protein of unknown function DUF558  46.9 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2764  protein of unknown function DUF558  46.96 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162938  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12397  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  48.39 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000494529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13560  conserved hypothetical protein TIGR00046  55.9 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2208  protein of unknown function DUF558  48.41 
 
 		 252 aa  178  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.332319  hitchhiker  0.00486279 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1971  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  44.71 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000062031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1266  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  53.33 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2234  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  42.86 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00121971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17280  conserved hypothetical protein TIGR00046  45.11 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11710  conserved hypothetical protein TIGR00046  42.75 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.444183  normal  0.98437 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12350  conserved hypothetical protein TIGR00046  43.75 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0978369  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0866  RNA methyltransferase, RsmE family  34.69 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0598  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  36.6 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3387  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  38.87 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0765647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1332  protein of unknown function DUF558  29.55 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000369372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3050  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  35.17 
 
 		 244 aa  121  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12770  conserved hypothetical protein TIGR00046  27.16 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000425435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2303  hypothetical protein  30.96 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2076  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  27.8 
 
 		 245 aa  118  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0337  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  34.23 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2434  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  26.78 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454475  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0201  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  34.51 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4289  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.19 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00156993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3079  hypothetical protein  34.17 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2370  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  35.14 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00405719  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1016  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.67 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2960  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.98 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000379617  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1823  hypothetical protein  29.44 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1500  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  38.77 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0500353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0587  hypothetical protein  33.04 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.256095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05450  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  40.69 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0519  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  39.09 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5288  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  37.73 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0610  protein of unknown function DUF558  35 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0995  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.61 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07670  conserved hypothetical protein TIGR00046  30.23 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.437211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1319  hypothetical protein  27.87 
 
 		 247 aa  101  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.681076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3710  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.51 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0165394  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1575  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  29.22 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.214687  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3218  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000318733  hitchhiker  0.0000151601 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1732  hypothetical protein  30.58 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.127797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3908  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.51 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000146224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0467  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0224  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.35 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0832  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.71 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2898  protein of unknown function DUF558  31.53 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4134  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.22 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0859841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4985  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  37.5 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0503  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.08 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000164616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1575  hypothetical protein  25.1 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0110049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0600  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.25 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.604988  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4859  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  37.5 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.771335  normal  0.0487283 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3004  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.88 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0546  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.08 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00942051  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3444  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.71 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000682278  hitchhiker  0.00874586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2493  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.74 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0412  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  38.07 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2865  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  30.77 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0719  hypothetical protein  32.43 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000868128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4321  hypothetical protein  27.94 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0240  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.77 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000270837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0690  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  32.24 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000126975  normal  0.647464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3038  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  33.61 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0446  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  35.74 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5035  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  37.5 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0123  hypothetical protein  32.09 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.138366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2251  hypothetical protein  28.82 
 
 		 245 aa  95.5  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00851758  unclonable  0.000000139128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5076  conserved hypothetical protein TIGR00046  35.45 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0227  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.53 
 
 		 247 aa  95.1  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1795  protein of unknown function DUF558  32.2 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2054  hypothetical protein  36.68 
 
 		 249 aa  95.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1549  hypothetical protein  30.33 
 
 		 259 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3332  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.78 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000119246  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0173  protein of unknown function DUF558  26.46 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0841  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.31 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000333783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1145  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  21.34 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0809  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.31 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000013307  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0834  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  31.31 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000360607  hitchhiker  0.00000221121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>