More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3246 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
156 aa  308  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  74.84 
 
 
156 aa  225  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  73.89 
 
 
160 aa  223  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  70.59 
 
 
162 aa  216  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  68.18 
 
 
155 aa  209  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  64.52 
 
 
164 aa  197  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  61.54 
 
 
157 aa  191  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  66.45 
 
 
186 aa  191  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  62.82 
 
 
159 aa  190  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  63.16 
 
 
149 aa  189  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  61.01 
 
 
156 aa  189  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  59.62 
 
 
170 aa  187  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  64.52 
 
 
153 aa  184  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  58.17 
 
 
183 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  62.5 
 
 
167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  60.76 
 
 
153 aa  181  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  57.62 
 
 
184 aa  181  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  60.9 
 
 
150 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  58.28 
 
 
178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  56.95 
 
 
177 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  56.95 
 
 
177 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  56.95 
 
 
177 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  59.62 
 
 
159 aa  177  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  58.55 
 
 
187 aa  176  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  59.01 
 
 
173 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  61.84 
 
 
157 aa  174  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  59.6 
 
 
182 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  58.55 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  55.13 
 
 
151 aa  169  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  58.17 
 
 
201 aa  169  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  61.78 
 
 
150 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  51.61 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  56.29 
 
 
179 aa  155  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  51.92 
 
 
153 aa  147  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  47.44 
 
 
186 aa  147  6e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  48.7 
 
 
166 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  48.65 
 
 
182 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  55.03 
 
 
157 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  38.03 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  42.14 
 
 
181 aa  92.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  38.46 
 
 
155 aa  91.7  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  38.46 
 
 
155 aa  91.7  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  37.4 
 
 
155 aa  90.9  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  41.83 
 
 
301 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  38.21 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  36.43 
 
 
152 aa  87.4  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  39.31 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  37.61 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  37.93 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  40 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  37.58 
 
 
156 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  37.58 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  37.58 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  37.58 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  37.58 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  37.58 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  37.58 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  41.32 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  39.17 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  40.5 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  38.79 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  39.29 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  38.1 
 
 
180 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  41.59 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  35 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  36.84 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  38.46 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  30.97 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  40.35 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  36.84 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  36.89 
 
 
180 aa  77  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  29.41 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  32.48 
 
 
142 aa  77  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  35.4 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  30.38 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  42.11 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  42.11 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  33.77 
 
 
446 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  41.58 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  42.45 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  35.4 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  28.67 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  32.85 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  32.89 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  34.48 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  34.48 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1119  metal-dependent hydrolase  34.13 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  34.19 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  32.39 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  35.46 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  32.26 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  35.58 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  35.46 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  30.77 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  38.02 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  34.71 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  37.82 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  35.29 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  42.11 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>