210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3213 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
390 aa  707    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  43.86 
 
 
381 aa  236  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  43.66 
 
 
398 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 
386 aa  204  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  32.63 
 
 
405 aa  199  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  39.06 
 
 
417 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  41.76 
 
 
388 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  40.12 
 
 
403 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 
378 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 
387 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  42.09 
 
 
441 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 
391 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 
403 aa  186  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  41.14 
 
 
395 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 
383 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  36.9 
 
 
396 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  44.9 
 
 
470 aa  176  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  37.53 
 
 
391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 
377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1792  major facilitator superfamily protein  41.49 
 
 
403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  38.89 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  38.08 
 
 
443 aa  173  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  42.74 
 
 
400 aa  173  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  45.43 
 
 
393 aa  172  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 
387 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  38.89 
 
 
383 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  38.62 
 
 
384 aa  171  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
388 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 
398 aa  170  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  34.65 
 
 
397 aa  169  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 
402 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  36.65 
 
 
396 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  34.08 
 
 
397 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  34.38 
 
 
384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 
465 aa  166  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  37.9 
 
 
462 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 
397 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 
405 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 
411 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  36.13 
 
 
414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  26.42 
 
 
386 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2762  major facilitator transporter  38.26 
 
 
384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1443  major facilitator transporter  38.26 
 
 
384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00314587  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2841  major facilitator transporter  38.26 
 
 
384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.968636  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  35.81 
 
 
385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  35.81 
 
 
385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  35.73 
 
 
396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  35.81 
 
 
385 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
386 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 
385 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  39.37 
 
 
389 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 
396 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  37.84 
 
 
384 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  38.34 
 
 
386 aa  159  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  36.36 
 
 
403 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  36.66 
 
 
378 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  36.66 
 
 
378 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  36.66 
 
 
378 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  36.66 
 
 
378 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  36.66 
 
 
378 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  36.66 
 
 
378 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 
387 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  35.92 
 
 
378 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 
433 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  38.4 
 
 
401 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 
379 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 
408 aa  152  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  37.97 
 
 
400 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  32.96 
 
 
391 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  36.46 
 
 
408 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  35.77 
 
 
404 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  36.24 
 
 
409 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  36.78 
 
 
399 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  36.78 
 
 
399 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  36.78 
 
 
399 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 
389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  32.45 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  32.45 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  31.03 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  32.45 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  32.45 
 
 
402 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  32.18 
 
 
402 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  32.18 
 
 
402 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 
407 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 
389 aa  146  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  32.45 
 
 
402 aa  146  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  39.69 
 
 
392 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  36.12 
 
 
383 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  34.99 
 
 
392 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  35.22 
 
 
377 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  37.96 
 
 
397 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  36.21 
 
 
383 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  36.51 
 
 
400 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>